国企职工档案出生时间有涂改，单位人事部门不能直接按照国家规定认定，需结合具体情况及程序进行判断。以下从不同角度为你详细分析：

档案出生时间涂改的认定原则

1. 真实性原则：档案作为记录个人重要信息的文件，其内容的真实性至关重要。如果档案中的出生时间被涂改，首先需要确认涂改的原因和性质。如果是无意涂改或因笔误等轻微原因导致的，且能够提供充分证据证明原始出生时间的，单位人事部门在核实后可能会按照原始出生时间进行认定。
2. 合法性原则：档案的涂改必须符合法律法规的规定。如果涂改行为违反了相关法律法规，如伪造、变造档案等，那么这种涂改是不被认可的，单位人事部门将不会按照涂改后的出生时间进行认定，并可能依法追究相关责任人的法律责任。

单位人事部门的认定程序

1. 初步审查：单位人事部门在发现档案出生时间涂改后，会首先进行初步审查，了解涂改的具体情况，包括涂改的时间、方式、原因等。
2. 调查核实：初步审查后，单位人事部门会进一步调查核实，可能包括与职工本人沟通、查阅相关证明材料、询问相关人员等，以确认涂改的真实性和合法性。
3. 作出认定：在调查核实的基础上，单位人事部门会根据相关法律法规和单位规定，作出是否认可涂改后出生时间的认定。如果认定涂改无效，将按照原始出生时间或相关法律法规规定的其他方式进行认定。

可能的法律后果

1. 对职工的影响：如果档案出生时间被涂改且不被认可，可能会影响职工的退休年龄、工龄计算、福利待遇等。例如，如果涂改后的出生时间比实际年龄小，可能导致职工延迟退休；反之，则可能导致职工提前退休或影响工龄计算。
2. 对单位的影响：如果单位人事部门在认定过程中存在疏忽或违规行为，如未按规定程序进行调查核实、未依法追究相关责任人的法律责任等，可能会面临法律风险和行政责任。

建议与措施

1. 及时沟通：如果发现档案出生时间被涂改，职工应及时与单位人事部门沟通，说明情况并提供相关证明材料。
2. 依法维权：如果单位人事部门的认定结果存在争议或不合理之处，职工可以依法向相关部门投诉或申请仲裁、诉讼等法律途径维护自己的合法权益。
3. 加强档案管理：单位应加强对档案的管理和保护，防止档案被涂改或损毁。同时，应建立健全档案管理制度和程序，确保档案的完整性和真实性。

总结来说，国企职工档案出生时间有涂改时，单位人事部门不能直接按照国家规定认定，而需结合具体情况及程序进行判断。职工和单位都应积极应对，确保档案的完整性和真实性，维护各自的合法权益。如果你有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，可以直接向我咨询。