结论：政府扣车是否合法，需根据具体情况判断，包括砍伐证是否有效、砍伐行为是否超出许可范围、扣车程序是否合法等。以下从多个角度进行分析：
砍伐证的有效性：
- 若砍伐证是合法有效的，且砍伐行为完全在砍伐证规定的范围内进行，那么政府扣车可能缺乏合法依据。因为在此情况下，砍伐行为是合法的，政府无权因合法的砍伐行为而扣车。
- 若砍伐证存在瑕疵（如过期、伪造、超出许可范围等），或者砍伐行为超出了砍伐证规定的范围，那么政府扣车可能是合法的。因为此时砍伐行为可能构成违法，政府有权依法采取扣车等行政强制措施。
砍伐行为的合法性：
- 即使持有砍伐证，如果砍伐行为违反了相关法律法规（如砍伐了禁止砍伐的树木、砍伐数量超过了许可数量等），那么政府扣车也是合法的。因为违法砍伐行为需要受到法律的制裁，扣车是其中一种可能的行政强制措施。
- 如果砍伐行为完全符合法律法规和砍伐证的规定，那么政府扣车则缺乏合法依据，可能构成违法行政。
扣车程序的合法性：
- 政府扣车必须遵循法定程序，包括出示执法证件、告知扣车理由、制作扣车清单等。如果政府在扣车过程中未遵循法定程序，那么扣车行为可能因程序违法而无效。
- 如果政府扣车程序合法，且砍伐行为确实存在违法情形，那么政府扣车则是合法的行政强制措施。
法律建议：
- 如果您认为政府扣车行为不合法，可以首先与政府相关部门进行沟通，要求其说明扣车理由和依据。
- 如果沟通无果，您可以考虑通过行政复议或行政诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。在行政复议或行政诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明自己的砍伐行为是合法的，或者政府扣车行为存在违法情形。
可能的法律后果：
- 如果政府扣车行为合法，且您的砍伐行为确实存在违法情形，那么您可能需要承担相应的法律责任，包括罚款、赔偿损失等。
- 如果政府扣车行为不合法，或者您的砍伐行为完全合法，那么政府可能需要承担违法行政的责任，包括返还车辆、赔偿损失等。
进一步思考：
- 在处理此类纠纷时，关键在于明确砍伐行为的合法性和政府扣车程序的合法性。因此，建议您在砍伐前仔细了解相关法律法规和砍伐证的规定，确保自己的砍伐行为合法合规。
- 如果遇到政府扣车等行政强制措施，建议您及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。
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