结论前置：关于“林业局树木砍伐证农民不在村里批砍伐证是否合法”的问题，关键在于砍伐证的审批权限和程序是否符合法律规定，而非单纯由村里审批。若林业局是依法定程序和权限进行审批，则农民不在村里批砍伐证并不直接构成违法；但若林业局未依法审批或存在违规操作，则可能涉及违法问题。以下从多个角度进行详细分析：
一、砍伐证的审批权限与程序
审批权限：
- 根据《中华人民共和国森林法》及相关规定，采伐林木必须申请采伐许可证，并由林业主管部门（如林业局）进行审批。这意味着，砍伐证的审批权限主要在林业主管部门，而非村里。
审批程序：
- 农民在申请砍伐证时，应向林业主管部门提交相关材料，如林木所有权证书、采伐地点、株数等，并符合林业主管部门的要求。
- 林业主管部门在收到申请后，会进行审查，并根据实际情况决定是否批准砍伐证。这一过程中，村里可能并不直接参与审批，但可能作为基层组织提供协助或意见。
二、农民不在村里批砍伐证的情况分析
合法情况：
- 如果林业局是依法定程序和权限进行审批，且农民已经按照要求向林业主管部门提交了申请材料，那么农民不在村里批砍伐证并不构成违法。因为审批权限在林业主管部门，村里并非审批主体。
违法情况：
- 如果林业局未依法审批砍伐证，如未按照法定程序进行审查、未考虑生态保护等因素而随意批准，或者存在违规操作（如收受贿赂、徇私舞弊等），则可能涉及违法问题。
- 另外，如果农民未按照要求向林业主管部门提交申请材料，而是试图通过村里或其他非正规渠道获取砍伐证，这也可能构成违法行为。
三、农民应如何正确申请砍伐证
了解法律法规：
- 农民在申请砍伐证前，应了解《中华人民共和国森林法》及相关规定，明确采伐林木必须申请采伐许可证，并了解审批程序和要求。
准备申请材料：
- 农民应准备齐全、准确的申请材料，包括林木所有权证书、采伐地点、株数等，并确保材料符合林业主管部门的要求。
向林业主管部门提交申请：
- 农民应向当地林业主管部门提交申请材料，并按照要求填写申请表、提供相关证明文件等。
配合审查与等待审批结果：
- 在提交申请后，农民应配合林业主管部门的审查工作，如提供必要的补充材料、接受现场勘查等。同时，耐心等待审批结果，并根据结果采取相应措施。
四、若遇到审批问题应如何处理
主动沟通与咨询：
- 如果农民在申请砍伐证过程中遇到问题或疑问，应主动与林业主管部门沟通咨询，了解具体原因和解决方案。
申请行政复议或诉讼：
- 如果农民认为林业主管部门的审批决定存在错误或不合理之处，可以在法定期限内申请行政复议或依法提起行政诉讼，维护自身合法权益。
总结与提醒：农民在申请砍伐证时，应了解并遵守相关法律法规和审批程序，确保申请材料的齐全和准确。若遇到审批问题或疑问，应主动与林业主管部门沟通咨询，并在必要时寻求法律救济。同时，也要提醒农民注意保护生态环境，不要擅自砍伐树木或破坏生态环境。如有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。