结论：二审撤回起诉并撤销一审判决后，被告支付了部分欠款，剩余欠款是否构成新的法律关系，需分情况讨论，但通常情况下，剩余欠款仍属于原债权债务关系的延续，不构成新的法律关系，但可能因新的还款行为产生新的法律事实。
详细分析：
原债权债务关系的延续：
- 在民间借贷纠纷中，一旦借贷关系成立，即形成了明确的债权债务关系。即使在一审判决后，二审中原告撤回起诉并撤销了一审判决，这并不意味着原债权债务关系的消灭。
- 被告支付部分欠款的行为，是履行原债务的一部分，剩余欠款仍然是原债权债务关系中未履行的部分。因此，从法律关系的本质上讲，剩余欠款并未构成新的法律关系，而是原债权债务关系的延续。
新法律事实的产生：
- 尽管剩余欠款不构成新的法律关系，但被告支付部分欠款的行为确实产生了新的法律事实。这一行为可能影响诉讼时效的计算、利息的累积等法律后果。
- 例如，如果被告在支付部分欠款后，与原告就剩余欠款的偿还达成了新的协议（如延期还款、分期还款等），则这一新协议可能构成对原债权债务关系的变更或补充，从而产生新的法律事实。但即便如此，剩余欠款的基础法律关系仍然是原债权债务关系。
法律建议：
- 对于原告而言，应保留好所有与借贷关系相关的证据，包括借款合同、转账记录、聊天记录等，以便在需要时证明原债权债务关系的存在及剩余欠款的金额。
- 如果被告未按照约定履行还款义务，原告可以依据原债权债务关系向法院提起诉讼，要求被告偿还剩余欠款及可能产生的利息、违约金等。
- 在诉讼过程中，原告应注意诉讼时效的问题。一般来说，民间借贷纠纷的诉讼时效为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。但如果被告在诉讼时效期间内支付了部分欠款，则诉讼时效可能从中断时重新计算。
特殊情况说明：
- 如果在二审撤回起诉并撤销一审判决后，原告与被告就剩余欠款达成了全新的协议，且该协议与原债权债务关系在内容、性质等方面存在显著差异，那么这种情况下剩余欠款可能构成新的法律关系。但这种情况较为少见，且需要具体分析协议内容来确定。
总结：
二审撤回起诉并撤销一审判决后，被告支付了部分欠款，剩余欠款通常仍属于原债权债务关系的延续。但被告支付部分欠款的行为可能产生新的法律事实，影响诉讼时效的计算等法律后果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。