结论：在此种情况下，原告可按正常诉讼流程向法院申请立案并推进诉讼，重点在于合理运用间接证据构建完整证据链，同时针对被告可能提交的直接证据做好应对准备。以下为详细说明：

原告申请立案及推进诉讼的流程

1. 准备起诉材料
   • 起诉状：需明确写明原被告的基本信息、具体的诉讼请求（例如要求确认第二次房屋买卖合同无效、要求被告承担违约责任等）、事实与理由（详细阐述一房二卖的情况，包括房屋的基本信息、两次买卖的时间顺序、相关交易细节等）。
   • 证据材料：将原告所掌握的间接证据进行整理和分类。间接证据是指不能直接证明案件主要事实，但能和其他证据联系起来，共同证明案件事实的证据。例如，房屋中介的证人证言，中介可以证明被告与不同买家就同一房屋进行交易洽谈的情况；房屋交易过程中的沟通记录，如短信、微信聊天记录、邮件等，从中可能发现被告存在一房二卖的意图或行为线索；房屋的产权登记信息，显示房屋的产权状态以及是否存在异常变更等情况。
2. 向法院提交申请
   • 原告应向有管辖权的人民法院提交起诉状和相关证据材料。一般来说，房屋买卖合同纠纷由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。提交材料后，法院会对起诉材料进行审查，符合立案条件的，法院会予以立案，并向原告送达立案通知书等相关文件。
3. 参与诉讼过程
   • 庭前准备：在立案后，原告需要进一步梳理和完善证据，分析被告可能提出的抗辩理由和证据。可以制作证据清单，对每一份证据的来源、证明目的等进行详细说明，以便在庭审中清晰地向法官展示。
   • 庭审阶段：在庭审中，原告要按照法庭程序进行陈述、举证、质证和辩论。在举证环节，要清晰地向法庭说明每一份间接证据与案件事实的关联性，以及如何通过这些间接证据形成一个完整的证据链来证明一房二卖的事实。例如，通过证人证言和沟通记录相互印证，证明被告在与原告签订买卖合同后，又与他人就同一房屋签订了买卖合同。
   • 庭后工作：庭审结束后，原告可以根据庭审情况，在规定的期限内向法院提交书面代理意见，进一步阐述自己的观点和理由，强化自己的主张。

针对被告可能提交的直接证据的应对策略

1. 审查证据的真实性
   • 直接证据虽然能够直接证明案件事实，但并不意味着其一定是真实有效的。原告要仔细审查被告提交的直接证据，例如，如果被告提交的是第二次房屋买卖合同作为直接证据，原告要查看合同的签订时间、签字盖章是否真实、是否存在伪造、变造等情况。可以通过申请司法鉴定等方式来确认证据的真实性。
2. 质疑证据的合法性
   • 即使证据是真实的，但如果其取得方式不合法，也可能不被法院采纳。例如，如果被告是通过威胁、欺诈等非法手段迫使他人签订相关文件来作为证明一房二卖的证据，原告可以指出其违法性，要求法院排除该证据。
3. 分析证据的关联性
   • 有些证据虽然看似直接，但可能与案件事实没有实际关联。原告要分析被告提交的直接证据与一房二卖这一核心事实之间的关联性。例如，被告提交的一份文件可能只是涉及房屋的其他事项，与两次买卖房屋的行为并无直接关系，原告可以据此说明该证据不能证明一房二卖的事实。