单位将房屋出租并自行收取租金是否违法，需分情况讨论，具体如下：

1. 单位具备合法出租权且程序合规

   • 若单位是房屋的合法所有权人或管理人（如国有企业经授权管理公有住房），且出租行为符合《民法典》中关于租赁合同的规定（如签订书面合同、明确租赁期限、租金等条款），则自行收取租金属于合法经营行为，不构成违法。
   • 法律依据：根据《民法典》第七百零三条，租赁合同是出租人将租赁物交付承租人使用、收益，承租人支付租金的合同。单位作为出租人，有权收取租金。

2. 单位无合法出租权或程序违规

   • 无权出租：若单位未经房屋所有权人同意（如未取得产权单位授权），擅自将房屋出租并收取租金，可能构成无权处分，需承担返还租金、赔偿损失等民事责任；若情节严重（如多次转租、骗取租金），可能涉嫌《刑法》第二百六十六条的诈骗罪。
   • 程序违规：若单位出租房屋未履行法定程序（如未通过公开招租、未报相关部门备案），可能面临行政处罚（如罚款、责令整改），但一般不直接导致租赁合同无效，租金仍可合法收取（但需补办手续）。
   • 特殊房屋类型：若房屋属于公租房、廉租房等保障性住房，单位未经批准擅自出租的，可能违反《公共租赁住房管理办法》等规定，需承担行政责任，租金可能被没收。

3. 税务合规性

   • 单位出租房屋并收取租金，需按《税收征收管理法》及房产税、增值税等相关规定申报纳税。若未依法纳税，可能面临税务机关的追缴、罚款甚至刑事责任（如逃税罪）。
   • 建议：单位应保留租金收入凭证，定期向税务机关申报纳税，避免税务风险。

法律建议：

• 单位在出租房屋前，应确认自身对房屋的合法处分权，并履行内部审批程序（如国有企业需经上级主管部门同意）。
• 签订书面租赁合同，明确双方权利义务，避免口头协议引发的纠纷。
• 依法办理房屋租赁备案手续（如当地要求），确保租赁行为合法有效。
• 按时申报纳税，保留完税凭证，避免税务风险。

若您是单位相关负责人或承租方，对房屋出租的合法性、合同条款或税务问题有疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情为您提供详细解答。