上班迟到罚加班费这一做法，在多数情况下是不合法的。下面我将从加班费支付和迟到扣工资两个角度，为你详细分析这一问题。
加班费支付
根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，用人单位安排劳动者加班的，必须按照国家规定支付加班费。具体标准如下：
- 工作日加班：若用人单位依法安排劳动者在日法定标准工作时间以外延长工作时间，需按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付加班费。
- 休息日加班：若用人单位依法安排劳动者在休息日工作且不能安排补休，需按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%支付加班费。
- 法定休假日加班：若用人单位依法安排劳动者在法定休假节日工作，需按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班费。
关键点：加班费是用人单位因安排劳动者加班而应支付的额外报酬，与劳动者是否迟到无关。因此，用人单位不能以迟到为由，拒绝支付或扣除加班费。
迟到扣工资
关于迟到扣工资的问题，法律并未明文禁止，但用人单位在实施时需遵循以下原则：
规章制度的合法性：
- 内容合法：用人单位制定的关于迟到扣工资的规章制度不能违反法律法规的强制性规定。例如，规定迟到一次就扣除当月全部工资显然不合理且不合法。
- 程序合法：根据《劳动合同法》，用人单位在制定涉及劳动者切身利益的规章制度时，应经职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。
合理性原则：
- 扣工资幅度应合理。如果因迟到几分钟就被扣除当天甚至几天的工资，这种扣罚显然不合理，可能对劳动者的权益造成过度侵害。
关键点：迟到扣工资需基于合法且合理的规章制度，且扣罚幅度应适中，不能过度侵害劳动者的权益。用人单位不能以迟到为由，将本应支付的加班费作为罚款扣除。
劳动者权益保护
如果用人单位存在不支付加班费或不合理扣发工资的行为，你可以采取以下措施维护自己的合法权益：
- 协商解决：首先尝试与用人单位进行友好协商，寻求问题的合理解决。
- 投诉举报：若协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉举报用人单位的违法行为。
- 申请劳动仲裁：在必要时，你可以依法向劳动仲裁机构申请仲裁，以维护自己的合法权益。
综上所述，上班迟到罚加班费这一做法在多数情况下是不合法的。用人单位应依法支付加班费，并合理制定和执行关于迟到扣工资的规章制度。如果你遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。