公交公司以绩效工资扣罚迟到是否合法，需分情况讨论：

1. 若公司规章制度合法且明确规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或决定有关劳动报酬、工作时间等直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，应当经职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定。若公交公司的规章制度经过上述民主程序制定，且内容合法、合理，明确规定了迟到与绩效工资扣罚的关联，那么公司以此扣罚迟到员工的绩效工资，在程序上和实体上均可能是合法的。
   • 举例：假设公交公司规章制度中明确规定，员工每月迟到超过3次，每次扣罚当月绩效工资的5%，且该制度已经职工代表大会讨论通过并公示。在此情况下，若员工迟到超过规定次数，公司按照制度扣罚绩效工资，是合法的。

2. 若公司规章制度不合法或未明确规定：

   • 如果公交公司的规章制度未经民主程序制定，或者内容违反法律、行政法规的规定，如扣罚比例过高、缺乏合理性等，那么该规章制度可能无效。在此情况下，公司以绩效工资扣罚迟到可能缺乏合法依据。
   • 举例：若公交公司规章制度中未规定迟到与绩效工资扣罚的关联，或者规定扣罚比例过高（如迟到一次扣罚当月全部绩效工资），且该制度未经职工代表大会讨论通过或未公示，那么公司以此扣罚迟到员工的绩效工资，可能是不合法的。

3. 需考虑扣罚的合理性：

   • 即使公司规章制度合法且明确规定，扣罚迟到员工的绩效工资也需考虑合理性。如果扣罚比例过高，导致员工实际收入大幅减少，甚至低于当地最低工资标准，那么这种扣罚可能被视为不合理，从而失去合法性。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第四十八条，用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。若扣罚后员工工资低于此标准，公司行为可能违法。

法律建议：

• 对于员工而言，若认为公司扣罚绩效工资不合法或不合理，可首先与公司协商解决；协商无果的，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
• 对于公交公司而言，应确保规章制度的合法性和合理性，明确规定迟到与绩效工资扣罚的关联，并经过民主程序制定和公示。同时，在扣罚员工绩效工资时，应确保扣罚比例合理，不违反法律、行政法规的规定。

可能后果：

• 若公司扣罚绩效工资合法且合理，员工需接受扣罚；若公司行为违法或不合理，员工有权要求公司补发被扣罚的工资，并可能获得相应的经济补偿。

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