结论前置：没有产权证的商业用房被别人强占，这一行为是否违法，需根据房屋的具体性质、强占行为的性质以及是否遵循了法定程序来综合判断。
一、合法强占的特殊情况（但通常不涉及“强占”的合法性，而是处理方式的合法性）
违章建筑的依法处理：
- 若该商业用房未经规划许可擅自建设，或不符合土地利用总体规划等，被法定程序认定为违章建筑。在此情况下，相关部门有权按照法律规定的流程（包括立案、调查取证、告知陈述申辩权、下达限期拆除决定书等）进行处理。但即便如此，“强占”行为本身并不合法，只是相关部门在依法处理违章建筑时可能采取的措施（如强制拆除）是合法的。这里的“合法”是指处理违章建筑的程序合法，而非强占行为本身。
征收拆迁中的合法处理：
- 在合法的征收拆迁项目中，若该商业用房位于征收范围内，且被征收人已收到补偿决定但在规定期限内未搬迁，也未通过法律途径对补偿决定提出异议（如申请复议或提起诉讼），则作出补偿决定的市、县级人民政府可依法申请人民法院强制执行。但同样，这里的“合法”是指征收拆迁的程序合法，强占（或更准确地说是强制执行）行为需经法院审查并准予执行后才合法。
二、违法强占的情况
未经认定直接强占：
- 若行政机关或任何个人、组织未经过任何法定程序，也未对房屋的合法性进行认定，就直接实施强占，这是违法的。无论房屋是否有产权证，都不能随意强占，行政机关有责任进行调查核实，确定房屋的合法性。
程序违法导致的强占：
- 即使房屋存在问题，但行政机关或强占者在强占过程中未遵循法定程序，如未提前告知当事人相关权利、未进行公告、未给予合理的搬迁期限等，此类强占也是违法的。
合法建筑的无证强占：
- 对于因历史原因、政府政策或其他合法原因（如具有合法的建房用地审批手续但未申领产权证）而未取得产权证的商业用房，若房屋本身符合相关规定，不能随意进行强占。应通过合法程序进行认定和处理，保障当事人的合法权益。
三、法律救济途径
- 如果您认为强占行为违法，可通过行政复议、行政诉讼等法律途径维护自己的合法权益。在行政复议中，您可以向作出强占决定的行政机关的上一级机关提出复议申请；在行政诉讼中，您可以向人民法院提起诉讼，要求确认强占行为违法并赔偿损失。
四、建议与提醒
- 在处理此类纠纷时，建议您首先收集并保存所有相关证据，包括房屋的建设手续、土地使用证明、强占行为的照片或视频等。
- 其次，及时咨询专业律师（即我，张昭鑫律师），以便更准确地判断强占行为的合法性，并制定有效的维权策略。
- 最后，保持冷静和理性，通过法律途径解决问题，避免采取过激行为导致事态恶化。
综上所述，没有产权证的商业用房被别人强占是否违法，需综合考虑房屋的性质、强占行为的性质以及是否遵循了法定程序等多个因素。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。