农村商业用地是有土地证的。以下从不同角度为你详细分析：

1. 法律依据角度：根据我国《土地管理法》及相关法规，土地实行登记发证制度。无论是农村的商业用地，还是其他用途的土地，只要符合法定条件，经过合法的审批程序，都可以依法取得土地证。土地证是土地权利人依法拥有土地使用权的法律凭证，它明确了土地的位置、面积、用途、使用期限等重要信息，对于保障土地权利人的合法权益至关重要。
2. 土地性质与用途角度：农村土地根据用途可分为农用地、建设用地和未利用地。商业用地属于建设用地的一种。在农村地区，如果要将土地用于商业开发，比如建设商场、酒店、商铺等，必须先将土地性质转变为建设用地，并依法办理相关的审批手续，包括土地征收、农用地转用审批等。在完成这些手续后，土地就可以按照商业用途进行开发利用，并依法取得土地证。
3. 实际案例角度：在实际生活中，我们也可以看到很多农村商业用地取得土地证的案例。比如，一些农村地区利用自身的资源优势，发展乡村旅游、特色商业等产业，将部分土地用于建设旅游设施、商业街区等。在这些项目中，土地权利人都会按照法定程序申请办理土地证，以确保自己的合法权益得到保障。