抵押权超过诉讼时效后，抵押人不能直接起诉要求撤销抵押权，但抵押权人可能丧失通过司法程序强制实现抵押权的权利。以下是对此问题的详细分析：
一、诉讼时效与抵押权的基本概念
诉讼时效：根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。超过诉讼时效，权利人虽仍享有权利，但可能丧失通过司法程序强制实现该权利的能力。
抵押权：抵押权是担保物权的一种，为担保债务的履行，债务人或第三人不转移财产的占有，将该财产抵押给债权人。当债务人不履行到期债务或发生约定的实现抵押权的情形时，债权人有权就该财产优先受偿。
二、诉讼时效届满对抵押权的影响
抵押权不因诉讼时效届满而消灭：抵押权作为物权，其存续不受诉讼时效限制。即使主债权诉讼时效经过，抵押权人依然保有抵押权，只是可能无法通过司法程序强制实现该权利。
抵押权行使的时效性：根据《中华人民共和国民法典》第四百一十九条，抵押权人应当在主债权诉讼时效期间行使抵押权；未行使的，人民法院不予保护。这意味着，若主债权超过诉讼时效，抵押权人虽仍可行使抵押权，但若抵押人提出时效抗辩，法院将不会通过强制力保护抵押权人的抵押权。
三、抵押人不能直接起诉撤销抵押权的原因
抵押权消灭的法定情形：抵押权的消灭需符合法定情形，如主债权消灭、抵押权实现、债权人放弃担保物权或法律规定担保物权消灭的其他情形。仅因主债权超过诉讼时效，并不直接导致抵押权消灭。
抵押权的独立性：抵押权作为物权，具有独立性，其存续不受主债权诉讼时效的限制。因此，抵押人不能仅因主债权超过诉讼时效就起诉要求撤销抵押权。
四、抵押权实现的可能限制与抵押人的权益
司法保护的时效性：主债权诉讼时效届满后，抵押权人虽保有抵押权，但无法通过司法强制执行程序实现抵押权。此时，抵押人可以援引时效抗辩，拒绝配合抵押权人通过司法程序实现抵押权。
抵押物的处置：若抵押权人与抵押人协商一致，抵押人自愿配合实现抵押权（如通过协商折价、拍卖等方式），法律并不禁止。但在此过程中，抵押人应确保处分过程符合法定程序，以保护自身权益。
抵押人可寻求的其他救济：如果抵押权人长期不行使抵押权，导致抵押物价值大幅降低，可能损害抵押人或其他债权人的利益。在此情况下，抵押人或其他利害关系人可以依据相关法律规定，通过一定程序请求注销抵押权或采取其他救济措施。但这与诉讼时效无直接关系，而是基于其他法律规定和案件具体情况。
总结与建议：
抵押权超过诉讼时效后，抵押人不能直接起诉要求撤销抵押权。但抵押权人可能因诉讼时效的经过而丧失通过司法程序强制实现抵押权的权利。在实际操作中，抵押人应关注主债权的诉讼时效情况，并在必要时援引时效抗辩来保护自身权益。如果抵押权人长期不行使抵押权或存在其他损害抵押人利益的行为，抵押人可以寻求法律救济或咨询专业律师（即我）以获取更具体的法律建议。