如果工伤认定部门存在违法行为，一般由其上级行政机关或者同级人民政府进行监督和管理。以下是对此问题的详细分析：

法律依据与监督机制

1. 行政监督：

   • 根据《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，公民、法人或者其他组织认为具体行政行为侵犯其合法权益的，可以向行政复议机关申请行政复议。工伤认定部门作为行政机关，其违法行为自然受到行政复议的监督。
   • 同时，根据《中华人民共和国行政诉讼法》，公民、法人或者其他组织认为行政机关和行政机关工作人员的行政行为侵犯其合法权益，有权依照本法向人民法院提起诉讼。这意味着，如果工伤认定部门的违法行为给当事人造成了损失，当事人可以通过行政诉讼来维护自己的权益。

2. 上级监督：

   • 工伤认定部门通常隶属于某一行政机关（如人力资源和社会保障局），其上级行政机关有权对其工作进行监督和管理。如果发现工伤认定部门存在违法行为，上级行政机关可以责令其改正，甚至对相关责任人进行处分。

3. 专门监督：

   • 除了行政监督和上级监督外，还有一些专门的监督机构（如监察委员会）负责对行政机关及其工作人员的违法行为进行监督和调查。如果工伤认定部门的违法行为涉嫌违纪或犯罪，这些专门监督机构将介入调查。

具体应对措施

1. 申请行政复议：

   • 如果当事人认为工伤认定部门的认定结果存在错误或违法行为，可以向其上级行政机关或者同级人民政府申请行政复议。行政复议机关将对原认定结果进行审查，并作出复议决定。

2. 提起行政诉讼：

   • 如果当事人对行政复议结果不满意，或者认为工伤认定部门的违法行为给自己造成了损失，可以向人民法院提起行政诉讼。法院将依法审理案件，并作出判决。

3. 向监察委员会举报：

   • 如果当事人认为工伤认定部门的违法行为涉嫌违纪或犯罪，可以向当地的监察委员会举报。监察委员会将依法进行调查，并根据调查结果作出相应处理。

注意事项

• 及时行动：如果当事人发现工伤认定部门存在违法行为，应及时采取行动，以免错过申请行政复议或提起行政诉讼的时效。
• 保留证据：在申请行政复议或提起行政诉讼前，当事人应尽可能收集并保留相关证据，以支持自己的主张。
• 寻求专业帮助：由于法律程序复杂且专业性强，当事人在处理此类问题时可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到有效维护。

作为专业律师，我建议你如果遇到工伤认定部门违法的情况，首先尝试通过行政复议或行政诉讼等法律途径来维护自己的权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。