针对您描述的情况，即消费者申请了仅退款，商家误操作同意退款且退款成功，同时消费者已签收商品，商家可以采取以下措施来应对：

1. 立即与消费者沟通协商：

   • 诚恳说明情况：第一时间主动联系消费者，诚恳地说明是由于误操作同意了退款申请，并表达希望消费者能够理解与合作。
   • 协商解决方案：根据消费者的意愿，协商出一个双方都能接受的解决方案。例如，可以提出重新发货、消费者撤销退款申请或改为退货退款等方案。
   • 保留沟通记录：在沟通过程中，务必保存好聊天记录或通话录音等证据，以备后续可能需要作为证明误操作或协商过程的依据。

2. 查看交易状态与平台规则：

   • 确认交易状态：检查订单状态，特别是款项是否已退回至消费者账户，以及商品是否已被签收，以便采取相应措施。
   • 研究平台规则：仔细阅读电商平台的售后规则、争议处理规则等，了解在误操作情况下的权利和可行的解决途径。不同平台可能有不同的规定，因此这一步至关重要。

3. 向平台申诉：

   • 收集证据：准备充分的证据来证明误同意退款的事实，包括与消费者的聊天记录、商品发货凭证、误操作截图等。
   • 提交申诉：及时向平台客服提交申诉，清晰阐述事情经过，并请求平台协助处理，如追回款项或纠正退款状态。在申诉时，要详细说明误操作的原因和过程，以及已经采取的沟通协商措施。
   • 遵循平台意见：积极配合平台客服的调查，并遵循平台的处理意见。如果平台认为需要消费者退货或提供其他补偿，商家应要求消费者配合执行。

4. 考虑法律途径：

   • 若消费者拒绝配合：如果消费者拒绝退货或提供补偿，且平台无法协助追回款项，商家可以考虑通过法律途径解决纠纷。在此之前，务必确保已经收集了充分的证据来支持自己的主张。
   • 咨询专业律师：虽然我在这里提供了一些建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在采取法律行动之前，建议商家咨询专业律师以获取更具体的法律意见。不过，您现在就可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。

5. 加强内部管理：

   • 优化退款流程：检查并优化退款流程，设置更严格的审核机制，如增加确认步骤或要求多人审核等，以避免类似误操作再次发生。
   • 员工培训：加强对员工的培训，提高他们对退款操作的认识和重视程度。确保员工在处理退款申请时更加谨慎和准确，减少误操作的可能性。

在处理此类纠纷时，商家应严格遵守相关法律法规，如《中华人民共和国电子商务法》等，合理维护自身权益。同时，也要保持与消费者的良好沟通，尽量通过协商解决问题，以维护商家的声誉和客户关系。如果商家在处理过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。