司法鉴定原则上必须依据经过质证的材料进行，这是确保鉴定意见合法性、客观性和关联性的核心要求。以下从法律依据、质证程序的重要性、例外情形及实践建议四个角度展开分析：

一、法律依据与程序要求

根据《中华人民共和国行政处罚法》第四十六条及司法鉴定相关规范，鉴定意见作为法定证据类型之一，其形成必须以合法、有效的材料为基础。虽然行政处罚法未直接规定“质证”程序，但《刑事诉讼法》及司法鉴定通用规则中明确要求：

1. 材料合法性：鉴定机构仅能对经法定程序收集、审查属实的材料进行鉴定。例如，在行政处罚中，若证据系通过非法手段（如刑讯逼供、利诱）获取，或严重违反法定程序收集，则不得作为鉴定依据。
2. 关联性审查：鉴定材料必须与待证事实直接相关。如食品检测报告中，进货台账、检验样本需与涉案产品批次一致，否则鉴定意见将因缺乏关联性被排除。
3. 客观性保障：鉴定机构需对材料真实性进行初步审查。例如，若当事人对物证（如不合格商品）的真实性提出异议，鉴定机构应要求提供原始购买凭证或封存记录，否则可能因材料瑕疵导致鉴定意见无效。

二、质证程序的核心作用

质证是确保鉴定意见科学性的关键环节，其价值体现在：

1. 排除非法证据：通过质证，当事人可对证据收集程序的合法性提出异议。例如，若行政机关未出示执法证件或单人取证，当事人有权拒绝配合，此类材料不得进入鉴定环节。
2. 验证材料真实性：质证过程中，当事人可对书证、物证的完整性提出质疑。如现场笔录未由当事人签名确认，或勘验笔录未记录关键细节，鉴定机构应拒绝受理或要求补充材料。
3. 保障程序公正：质证为当事人提供了反驳证据的机会。例如，在价格鉴定中，若当事人认为行政机关选定的鉴定机构缺乏资质，或鉴定方法不科学，可通过质证程序申请重新鉴定。

三、例外情形与特殊规则

尽管质证是原则性要求，但以下情形可简化程序：

1. 紧急情况下的先行登记保存：若证据可能灭失（如易腐烂食品），行政机关可先行登记保存，并在7日内完成质证程序。逾期未处理的，保存措施自动解除，相关材料不得作为鉴定依据。
2. 当事人自愿放弃质证：若当事人明确表示对材料无异议，或书面同意直接进入鉴定程序，行政机关可省略质证环节。但需注意，此情形下当事人仍保留事后申诉权利。
3. 技术性证据的特殊审查：对于专业性极强的证据（如DNA检测、工程造价鉴定），法院或行政机关可委托专家辅助人参与质证，或直接依据行业规范审查材料合法性。

四、实践建议与风险防范

1. 对行政机关的建议：

   • 严格遵循“两人执法”原则，确保取证程序合法；
   • 全程记录证据收集过程，避免因程序瑕疵导致鉴定意见被排除；
   • 在重大案件中，主动告知当事人质证权利，并留存书面确认记录。

2. 对当事人的建议：

   • 若对鉴定材料真实性存疑，应在质证阶段提出异议，并要求行政机关补充证据；
   • 发现行政机关未履行质证程序，可申请行政复议或提起行政诉讼，主张程序违法；
   • 涉及专业鉴定时，及时委托律师或专家辅助人参与质证，提高反驳证据的效力。

总结：司法鉴定必须以经过质证的材料为依据，这是程序公正与实体正义的双重保障。行政机关若忽视质证程序，可能导致鉴定意见被排除，进而影响处罚决定的合法性；当事人若未充分利用质证权利，可能丧失反驳证据的关键机会。如有具体案件需进一步分析，可直接向我咨询。