加班费并非只能追回两年内的，具体追溯期限需根据实际情况和相关法律法规综合判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、劳动行政保障部门的查处期限
根据《劳动保障监察条例》第二十条，若违反劳动保障法律、法规或规章的行为在两年内未被劳动保障行政部门发现，也未被举报或投诉，则劳动保障行政部门将不再查处。这一期限自违法行为发生之日起计算，若行为有连续或继续状态，则从行为终了之日起计算。但这一规定主要针对的是劳动行政部门的查处行为，并不直接限制劳动者通过仲裁或诉讼途径追讨加班费。
二、劳动仲裁及诉讼程序的追溯期限
仲裁时效：
- 根据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间通常为一年，自当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。然而，对于劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬（包括加班费）发生的争议，劳动者申请仲裁不受此一年时效的限制。
- 若劳动关系终止，劳动者需自劳动关系终止之日起一年内提出仲裁申请。多数地区倾向于将加班费认定为劳动报酬范畴，因此在劳动关系存续期间，劳动者主张加班费不受时效限制。
诉讼时效：
- 若劳动争议案件经过仲裁后进入诉讼阶段，根据《民法典》第一百八十八条，诉讼时效期间为三年，自权利人知道或应当知道权利受损及义务人之日起计算。这意味着，在诉讼阶段，劳动者追讨加班费的时效可能延长至三年。
三、特殊情况下的时效变动
时效中断与中止：
- 因当事人一方向对方主张权利、向有关部门请求救济或对方同意履行义务，时效中断并重新计算。
- 因不可抗力或其他正当理由无法在时效期内申请仲裁的，时效中止，原因消除后继续计算。
和解与调解协议的影响：
- 若双方就加班费支付达成和解或调解协议，劳动者在协议约定的履行期限届满后才申请仲裁的，时效从履行期限届满之日起重新计算。
恶意拖欠或劳动关系争议：
- 用人单位故意拖延支付加班费，或劳动者与用人单位间存在其他劳动关系争议影响加班费追讨的，时效期限可能受影响而中断或重新计算。
四、实际案例与证据保留
- 实际案例：以小李为例，他在某公司工作了5年，期间一直存在加班但未支付加班费的情况。若小李在离职后半年内申请劳动仲裁，要求支付这5年的加班费，并提供充分有效的证据证明加班事实，那么他主张这5年加班费的诉求有可能得到支持。
- 证据保留：劳动者应妥善保留考勤记录、工资单、加班通知等关键证据，以证明加班事实和加班费的计算依据。证据的充分性和有效性是追讨加班费成功的关键。
五、法律建议
- 及时主张权利：发现加班费被拖欠时，劳动者应及时向用人单位提出主张，并在时效期限内采取法律行动。
- 保留证据：妥善保留与加班相关的所有证据，以便在需要时提供证明。
- 了解法律：熟悉相关法律法规和时效规定，以便更好地维护自己的合法权益。
综上所述，加班费的追溯期限并非固定为两年，而是根据具体情况和相关法律法规综合判断。劳动者在遇到加班费问题时，应了解自己的权益和相关的法律程序，并在必要时寻求法律帮助。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。