领导故意扣绩效工资是否违法，需分情况讨论：
若公司有合法有效的绩效考核制度，且领导扣减绩效工资的行为符合该制度规定：
- 在这种情况下，领导扣减绩效工资的行为通常不构成违法。因为公司有权根据自身的经营状况和员工的工作表现，制定合理的绩效考核制度，并据此调整员工的工资。但前提是，该制度必须合法有效，即已经过民主程序制定、公示或告知员工，且内容不违反法律法规的强制性规定。
- 法律背景：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位有权根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。同时，用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
若公司没有合法有效的绩效考核制度，或领导扣减绩效工资的行为违反了该制度规定：
- 在这种情况下，领导扣减绩效工资的行为可能构成违法。因为公司没有合法的依据来扣减员工的工资，或者领导的行为超出了公司制度的授权范围，侵犯了员工的合法权益。
- 法律后果：员工有权要求公司补发被扣减的工资，并可能根据具体情况要求公司支付经济补偿金或赔偿金。如果公司拒绝补发或支付，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
若领导扣减绩效工资的行为存在恶意或歧视性：
- 即使公司有合法有效的绩效考核制度，如果领导扣减绩效工资的行为存在恶意或歧视性，如针对特定员工或特定群体进行不合理的扣减，也可能构成违法。因为这种行为违反了公平、公正的原则，侵犯了员工的平等就业权。
- 法律建议：员工在遇到这种情况时，应收集相关证据，如工资条、绩效考核表、与领导的沟通记录等，以证明领导的行为存在恶意或歧视性。然后，员工可以向公司的人力资源部门或高层管理人员反映情况，要求公司进行调查并处理。如果公司不予处理或处理不当，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
额外建议：
- 员工在入职时，应仔细阅读公司的规章制度和劳动合同，了解公司的绩效考核制度和工资调整机制。
- 在工作过程中，员工应保留好与工资、绩效考核相关的证据，以备不时之需。
- 如果员工对公司的绩效考核制度或工资调整机制有疑问或不满，应及时与公司沟通或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
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