您好，关于工伤认定申请由单位哪个部门办理的问题，这通常取决于单位内部的组织架构和管理流程，但一般来说，工伤认定申请主要由单位的人力资源部门或负责员工福利、安全管理的相关部门来负责办理。

具体来说，当职工在工作中发生事故伤害或被诊断为职业病时，单位应尽快安排人员协助受伤员工就医，并同时启动工伤认定申请流程。这个流程通常包括以下几个步骤：

1. 及时报告：单位在获悉事故后，应及时向当地的社保行政部门报告事故情况，这是启动工伤认定程序的第一步。

2. 准备材料：接下来，单位需要准备工伤认定申请所需的材料，这通常包括工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系的证明材料（如劳动合同、工作证等）、医疗诊断证明或职业病诊断证明书等。这些材料的准备和整理工作，往往由人力资源部门或相关负责部门来承担。

3. 提交申请：在准备好所有材料后，单位需要在规定的时间内（通常是事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起30日内）向用人单位所在地统筹地区的社会保险行政部门提交工伤认定申请。

4. 跟进处理：提交申请后，单位还需要与社会保险行政部门保持沟通，及时跟进工伤认定的处理进度，并根据需要提供补充材料或信息。

因此，虽然具体的办理部门可能因单位而异，但一般来说，人力资源部门或负责员工福利、安全管理的相关部门是承担工伤认定申请工作的主要部门。如果您对单位内部的办理流程有疑问，建议咨询您所在单位的人力资源部门或相关负责部门，以获取更准确的信息。