土地出让合同中的自持比例是否指计容面积，需结合合同具体条款及地方政策综合判断，但实践中通常以计容建筑面积为计算基准。以下从不同角度展开分析：

1. 合同条款优先原则
   若土地出让合同中明确约定“自持比例以计容建筑面积计算”，则直接依据合同执行。例如合同可能表述为：“受让人须自持项目总计容建筑面积的30%”，此时计容面积是唯一计算依据。
   若合同未明确，则需结合地方政策或行业惯例判断。

2. 计容面积的法定定义
   根据《建设工程建筑面积计算规范》及地方规划管理规定，计容建筑面积（计入容积率的建筑面积）通常指地上建筑面积中，符合规划条件可计入容积率的部分（如住宅、商业、办公等），不包括地下车库、设备用房等不计容部分。
   若自持比例以计容面积计算，则开发商需自持地上可销售或出租的核心经营空间，直接影响项目收益模式。

3. 非计容面积的排除逻辑
   若自持比例包含非计容面积（如地下车库），则开发商可能通过“技术性操作”减少自持成本（例如将自持部分转移至不计容的地下空间）。但此类约定需合同明确支持，否则可能因违反公平原则或地方政策被认定无效。
   例如，某市规划局曾明确要求“自持物业须全部位于地上计容部分”，以防止开发商规避监管。

4. 地方政策的差异化影响
   部分城市在土地出让条件中会直接规定自持面积的计算规则。例如：

   • 北京：要求“自持商品住房应全部为套内建筑面积90平方米以下的中小套型”；
     
   • 上海：在租赁住房用地中明确“自持面积以计容建筑面积为准，且不得分割转让”。
     建议结合项目所在地具体政策进一步核实。

实务建议：

• 开发商在竞拍土地前，应要求自然资源部门出具书面说明，明确自持比例的计算口径；
  
• 若合同存在歧义，可争取在补充协议中增加“自持面积=计容建筑面积×自持比例”的条款；
  
• 涉及复杂项目（如综合体、TOD开发），建议委托规划师与律师共同审核合同，避免因面积计算错误导致违约。
  

如有具体合同条款或地方政策需要解读，可进一步提供信息，我将为您详细分析。