协议约定签字盖章生效，但没盖章并不一定意味着协议无效，其效力需根据具体情况进行综合判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、法律基础与一般原则
根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这里的“签名”、“盖章”和“按指印”是选择关系，意味着只要满足其中之一，合同即具备成立的基本条件。因此，如果协议中仅提及“盖章签字生效”，但未明确必须同时具备两者，那么盖章或签字中的任何一项完成，都足以使协议成立并生效。
二、合同约定与生效条件的具体分析
未明确约定必须同时盖章和签字：
- 如果协议中没有明确约定“必须同时盖章和签字协议才生效”，那么根据法律规定，仅盖章或仅签字都可能使协议生效。此时，即使未盖章，只要协议内容真实、合法，且双方当事人意思表示均为真实，协议通常被认定为有效。
明确约定必须同时盖章和签字：
- 如果协议中明确约定了“本协议自双方签字并盖章之日起生效”等类似条款，那么未盖章的协议可能不符合约定的生效条件，从而被视为未生效或无效。但这一判断还需结合其他因素，如实际履行情况、当事人身份及签约资格等。
三、实际履行情况的影响
- 即使协议未同时满足盖章和签字条件，但如果一方已经履行了协议的主要义务，且对方已接受，根据《民法典》的相关规定，该协议仍被视为成立并生效。实际履行行为可以视为双方对协议存在和效力的确认。
四、当事人身份及签约资格的考量
自然人之间：
- 对于自然人之间签订的协议，只要双方均签字，且签字体现了对协议内容的认可和愿意受其约束的意思表示，该协议通常即成立并生效。无需额外盖章。
法人或组织与自然人之间：
- 若是法人（如公司、企业等）或其他组织与自然人签订协议，法定代表人或授权代表的签字行为，在其职权范围内，通常也足以使协议生效。但如果协议中明确约定了盖章为生效条件，且法人或组织未盖章，则协议可能被视为未生效或无效。
签字人权限问题：
- 若签字人未经授权或超越权限签字，且不能构成表见代理（即相对人无理由相信其有代理权），则该协议可能对法人或组织不发生效力。此时，即使协议中有盖章要求，但因签字人无权代表法人或组织签字，协议仍可能被视为无效。
五、特殊情况下的无效性
- 若协议内容违反了法律法规的强制性规定，无论是否签字盖章，该协议均属无效。
- 若一方在签订协议时存在欺诈、胁迫等手段，导致对方在违背真实意思的情况下签字或盖章，受损害方有权请求撤销该协议。
六、建议与实践
- 明确约定生效条件：为避免后续纠纷的发生，建议在签订协议时，双方应明确约定生效条件及签字盖章事宜。这包括但不限于明确是“签字或盖章”还是“签字并盖章”生效，以及盖章的具体要求（如盖章主体、印章类型等）。
- 谨慎对待签字盖章：在签订协议时，应谨慎对待签字盖章行为，确保签字人具有代表权或代理权，且盖章真实有效。
- 保留相关证据：在协议履行过程中，应保留好相关证据，如履行凭证、沟通记录等，以备不时之需。
总结来说，协议约定签字盖章生效但没盖章的情况下，协议是否有效需结合具体的合同约定、相关法律法规的规定以及实际情况进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。