结论：在路口直行待行区放行饱和时，后方直行车辆停在斑马线等候是否违法，需根据具体情况判断，一般情况下不直接视为违法，但需注意避免长时间停留或影响行人通行。

分析说明：

1. 交通法规的基本原则：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关实施条例，车辆和行人应当按照交通信号通行，在没有交通信号的道路上，应当在确保安全、畅通的原则下通行。
   • 斑马线是行人过街的专用通道，车辆在斑马线前应当减速让行，确保行人安全通过。

2. 直行待行区放行饱和时的处理：

   • 当直行待行区放行饱和，即前方车辆已经排满待行区，无法继续前行时，后方车辆应当根据实际情况选择合适的停车位置。
   • 如果后方车辆选择停在斑马线前等候，且该行为未造成交通拥堵或影响行人正常通行，一般不直接视为违法。但需注意，车辆不应长时间停留在斑马线上，以免妨碍行人通行。

3. 可能违法的情形：

   • 如果车辆停在斑马线上导致行人无法正常通行，或者长时间停留造成交通拥堵，那么该行为可能违反交通法规中关于“确保安全、畅通通行”的原则。
   • 在某些地区，可能有具体的交通管理规定或地方性法规，对车辆在斑马线前的停车行为有更明确的规定。如果违反这些规定，可能会受到相应的处罚。

4. 建议与注意事项：

   • 驾驶员在行驶过程中应密切关注交通信号和前方车辆动态，合理选择停车位置。
   • 如果直行待行区放行饱和，且后方车辆无法继续前行，建议驾驶员提前减速并寻找合适的停车位置，避免停在斑马线上。
   • 如果确实需要停在斑马线前等候，应确保不影响行人通行，并尽快寻找机会前行或让行。

特殊场景：

• 在交通高峰期或特殊天气条件下，交通流量可能大幅增加，导致直行待行区更容易放行饱和。此时，驾驶员应更加谨慎驾驶，遵守交通法规，确保行车安全。

行动建议：

• 如果您在驾驶过程中遇到类似情况，不确定自己的行为是否违法，建议保持冷静并观察周围交通状况，合理选择停车位置。
• 如果您因停车在斑马线上而收到交通违法通知或处罚，且认为该处罚不合理或存在争议，可以向相关部门提出申诉或咨询专业律师以获取更具体的法律建议。

如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。