耕地中有违建一般不能确权。以下从不同角度为你详细分析：

法律背景与规定

根据相关法律法规，土地确权是对土地权利归属的确认，旨在明确土地的所有权、使用权等权利归属情况。而违法建筑，是指未经规划土地主管部门批准，未领取建设工程规划许可证或临时建设工程规划许可证，擅自建筑的建筑物和构筑物。这类建筑本身就不符合法律法规的规定，其存在本身就是违法的。

在土地确权过程中，相关部门会严格审查土地的使用情况，包括土地上是否存在违法建筑。如果耕地上存在违法建筑，那么这块土地的使用情况就存在违法情形，不符合确权的基本条件。因此，从法律层面来讲，耕地中有违建是不能进行确权的。

实际操作与影响

1. 确权流程受阻：在土地确权的具体操作中，相关部门会进行实地勘查、调查取证等工作。如果发现耕地上有违法建筑，确权流程很可能会因此受阻。相关部门会要求先处理违法建筑问题，再进行确权工作。
2. 法律责任风险：对于耕地上的违法建筑，相关部门有权依法进行拆除、罚款等处罚。如果土地所有者或使用者不积极处理违法建筑问题，还可能面临更严重的法律责任。这也会间接影响到土地的确权工作。

特殊情况与建议

虽然耕地中有违建一般不能确权，但也存在一些特殊情况。例如，如果违法建筑是由于历史原因形成的，且已经存在了较长时间，相关部门在处理时可能会考虑一定的灵活性。然而，这种情况并不常见，且需要满足一定的条件。

建议：

• 积极处理违法建筑：如果耕地上存在违法建筑，建议土地所有者或使用者积极与相关部门沟通，了解违法建筑的处理方式和要求，并尽快进行处理。
• 咨询专业法律意见：在处理违法建筑和土地确权问题时，可能会涉及复杂的法律问题。因此，建议咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到妥善保护。

如果你在处理耕地违建或土地确权问题上遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。