结论：在公租房欠租案件中，若一审法院程序违法，二审时是可以进行调解的。
分析说明：
二审调解的法律依据：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，二审法院在审理上诉案件时，可以根据当事人的自愿原则进行调解。这意味着，无论一审法院是否存在程序违法的情况，只要当事人愿意，二审法院都有权进行调解。
一审程序违法对二审调解的影响：
- 一审法院程序违法并不直接影响二审法院的调解权。程序违法可能导致一审判决被撤销或改判，但这并不妨碍二审法院在审理过程中尝试通过调解解决纠纷。
- 如果一审程序违法影响了案件的公正审理，二审法院在调解时可能会更加谨慎，以确保调解结果的公正性和合法性。但这并不意味着二审法院不能进行调解，而是需要在调解过程中更加注重程序公正和实体公正的平衡。
调解在二审中的实际意义：
- 调解是一种灵活、高效的纠纷解决方式，可以节省当事人的时间和成本，避免长时间的诉讼过程。
- 在公租房欠租案件中，调解可能有助于双方达成和解，既保障了出租方的合法权益，又考虑了承租方的实际困难，有助于维护社会和谐稳定。
调解不成时的处理：
- 如果二审调解不成，二审法院将依法作出判决。如果一审程序违法确实影响了案件的公正审理，二审法院可能会撤销原判，发回重审或直接改判。
行动建议：
- 积极应诉并寻求调解：作为承租方或出租方，在收到二审法院的调解通知时，应积极应诉并表达调解意愿。通过调解解决纠纷可以节省时间和成本，同时也有助于维护双方的关系。
- 准备相关证据和材料：在调解过程中，双方应准备相关证据和材料以支持自己的主张。这有助于调解员更全面地了解案件情况，促进调解的成功。
- 咨询专业律师：虽然我在这里提供了一些基本的法律建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在调解过程中或之前，建议咨询专业律师以获取更具体的法律意见和帮助。
法律后果提示：
- 如果调解成功并达成调解协议，双方应认真履行协议内容。一方不履行调解协议的，另一方可以向法院申请强制执行。
- 如果调解不成且二审法院作出判决，双方应尊重并执行判决结果。对判决结果不服的，可以在法定期限内申请再审或提起上诉（但需注意，二审判决通常是终审判决，除非符合特定条件才能申请再审）。