针对乡镇府职工发现相互代签到签退但在岗在位的情况，我们可以结合一般的考勤管理制度原则以及您提供的参考信息，给出以下处理建议：

一、明确考勤制度的重要性

首先，需要向全体职工强调考勤制度的重要性。考勤制度是维护单位正常工作秩序、保证工作效率和公平性的基础。代签到签退行为不仅违反了考勤制度，也损害了单位的纪律性和公正性，必须予以严肃处理。

二、明确代签行为的性质及后果

1. 代签行为的性质：代签到签退是一种欺骗行为，它掩盖了真实的出勤情况，使得考勤数据失真，无法准确反映职工的工作状态。

2. 后果：

   • 对于被代签人：一旦发现代签行为，被代签人应被视为旷工或未出勤，根据单位规定接受相应的处罚，如扣减工资、绩效、警告、记过等。
   • 对于代签人：代签人同样应受到严肃处理，因为其行为助长了不诚信的风气，破坏了单位的考勤秩序。代签人可能面临批评教育、警告、记过甚至更严重的处罚。

三、具体处理措施

1. 调查核实：一旦发现代签行为，应立即进行调查核实，确认代签人和被代签人的身份以及代签的具体情况。

2. 严肃处理：根据调查结果，按照单位考勤制度的规定，对代签人和被代签人进行严肃处理。处理结果应公开透明，以儆效尤。

3. 加强教育：在处理代签行为的同时，应加强对全体职工的教育和引导，强调诚信出勤的重要性，提高职工的纪律意识和责任感。

4. 完善考勤制度：针对代签行为暴露出的问题，单位应进一步完善考勤制度，如采用更先进的考勤方式（如面部识别、指纹识别等）、加强考勤监督和管理等，以防止类似行为再次发生。

四、预防措施

1. 加强宣传教育：定期开展考勤制度宣传教育活动，提高职工对考勤制度的认识和重视程度。

2. 建立举报机制：鼓励职工对代签等违规行为进行举报，对举报属实的给予奖励和保护。

3. 定期检查：定期对考勤记录进行检查和审核，及时发现和处理异常情况。

综上所述，对于乡镇府职工发现相互代签到签退但在岗在位的情况，单位应明确考勤制度的重要性，严肃处理代签行为，并加强教育、完善制度和采取预防措施，以维护单位的正常工作秩序和公平性。