针对您提出的“自建房不合格法院是否会判支付尾款”的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况来综合判断的。以下是我从多个角度为您进行的分析：
合同约定与履行情况：
- 首先，要查看您与施工方或购房方（如果是出售自建房的情况）之间签订的合同中，是否有关于房屋质量、验收标准以及尾款支付条件的明确约定。
- 如果合同中明确规定了房屋需达到一定的质量标准，且验收合格后才支付尾款，而实际房屋质量未达标，那么法院在判决时很可能会依据合同约定，不支持支付尾款的请求。
房屋质量问题的严重性：
- 房屋质量问题分为轻微和严重两种。轻微的质量问题，如墙面小裂缝、地面不平整等，可能不会影响房屋的整体使用和安全，这种情况下，法院可能会考虑要求施工方进行修复，并视修复情况决定是否支付尾款。
- 如果房屋存在严重的质量问题，如结构安全隐患、严重漏水等，这些问题直接影响到房屋的使用和安全，法院很可能会判决不支持支付尾款，甚至可能要求施工方承担违约责任。
双方协商与调解情况：
- 在诉讼之前，双方是否尝试过协商或调解来解决纠纷也是一个重要的考虑因素。如果双方能够就房屋质量问题和尾款支付达成一致意见，并签订书面协议，那么法院在判决时很可能会尊重双方的协议。
- 如果双方无法协商或调解成功，那么法院将根据事实和法律规定进行判决。
法律程序与证据收集：
- 在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明房屋存在质量问题，如质量检测报告、照片、视频等。这些证据将直接影响法院的判决结果。
- 同时，您也需要了解并遵守相关的法律程序，如起诉、答辩、举证、质证等，以确保您的权益得到充分保障。
法律建议：
- 如果您发现自建房存在质量问题，且怀疑施工方可能无法履行修复义务或拒绝支付尾款，建议您及时收集相关证据，并咨询专业律师（即我，田映钧律师）的意见。
- 在诉讼过程中，保持冷静和理性，积极配合法院的工作，提供充分的证据来支持您的主张。
- 如果可能的话，尝试与施工方进行协商或调解，以达成双方都能接受的解决方案，避免不必要的法律纠纷和损失。
可能后果：
- 如果法院判决不支持支付尾款，您可能需要承担一定的诉讼费用和律师费用，但这也将为您挽回因房屋质量问题可能带来的更大损失。
- 如果法院判决支持支付尾款，但房屋确实存在质量问题，您可能需要后续投入更多的资金和精力来进行修复和整改。
综上所述，自建房不合格法院是否会判支付尾款，取决于多种因素的综合判断。如果您面临这样的问题，建议及时咨询专业律师（我，田映钧律师）的意见，以便更好地维护您的合法权益。