结论：非法开挖的鱼塘里长出的莲藕被损害，是否需要赔偿取决于多个因素，包括损害行为的性质、损害人的主观状态以及是否存在合法的权利基础等。以下从不同角度进行分析：
一、损害行为的性质
故意损害：
- 如果损害人是故意破坏莲藕，比如出于报复、恶意等心理，那么这种行为很可能构成侵权。根据《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的规定，故意侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。因此，在这种情况下，损害人需要赔偿莲藕的所有者因损害所遭受的损失。
过失损害：
- 如果损害人并非故意，而是由于疏忽大意或过于自信等过失行为导致莲藕受损，那么是否需要赔偿取决于损害人是否存在过错以及过错程度。在一般情况下，如果损害人存在过错，且该过错与莲藕受损之间存在因果关系，那么损害人可能需要承担一定的赔偿责任。
二、损害人的主观状态
善意损害：
- 如果损害人在损害莲藕时并不知道该鱼塘是非法开挖的，且没有其他过错，那么其赔偿责任可能会相对较轻或免除。但这并不意味着完全不承担责任，因为即使不知情，如果损害行为本身具有违法性或不当性，损害人仍可能需要承担一定的责任。不过，在实际操作中，这种情况下的赔偿责任往往较难确定。
恶意损害：
- 如前所述，如果损害人是出于恶意或故意破坏莲藕，那么其赔偿责任将更为明确和严重。损害人不仅需要赔偿莲藕的所有者因损害所遭受的直接损失，还可能需要承担其他法律责任，如赔礼道歉、消除影响等。
三、是否存在合法的权利基础
莲藕所有者的权利：
- 尽管鱼塘是非法开挖的，但莲藕作为生长在鱼塘中的植物，其所有权可能归属于实际种植或管理莲藕的人。如果莲藕所有者能够证明其对莲藕拥有合法的所有权或使用权，那么其有权要求损害人承担赔偿责任。
非法开挖鱼塘的影响：
- 非法开挖鱼塘本身是一种违法行为，但这并不意味着莲藕所有者就失去了对莲藕的所有权或使用权。然而，非法开挖鱼塘可能会引发一系列法律问题，如土地使用权争议、环境保护问题等。这些问题可能会间接影响莲藕所有者的权益和损害赔偿的确定。
四、建议与措施
收集证据：
- 莲藕所有者应尽快收集与损害行为相关的证据，如现场照片、视频、证人证言等。这些证据将有助于证明损害事实的存在以及损害人的过错程度。
协商与调解：
- 在可能的情况下，莲藕所有者可以尝试与损害人进行协商或调解，以达成赔偿协议。这可以节省时间和成本，并避免不必要的法律纠纷。
法律途径：
- 如果协商或调解无果，莲藕所有者可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。这包括向法院提起诉讼或申请仲裁等。在诉讼或仲裁过程中，莲藕所有者需要提供充分的证据来支持自己的主张，并遵循法律程序和规定。
最后，非法开挖的鱼塘里长出的莲藕被损害是否需要赔偿取决于多个因素。如果你作为莲藕的所有者或相关方遇到此类问题，建议直接向我咨询以获取更具体的法律建议和帮助。