结论：在有租房合同的情况下，欠房租超过两千元，只要符合法定的立案条件，法院是会受理立案的。

详细分析：

1. 民事诉讼立案条件：

   • 原告适格：在房租纠纷中，房东作为原告，因其对房租的收取享有直接的权益，是适格的原告。
   • 被告明确：拖欠房租的租客作为被告，其身份信息（如姓名、性别、工作单位、住所等）需明确。
   • 有具体的诉讼请求和事实、理由：房东需清晰陈述诉讼请求，如要求租客支付拖欠的房租具体金额、逾期利息等，并阐述租房合同的约定、租客拖欠房租的具体情况等事实和理由。
   • 管辖范围：房租纠纷通常由房屋所在地的基层人民法院管辖。
   • 金额对立案的影响：理论上，欠租金额的多少并不影响立案，只要符合上述立案条件，法院都会立案。但在实践中，对于金额较小的纠纷，当事人可能会考虑诉讼成本和效率，选择协商、调解等其他方式解决。不过，就您提出的情况，欠房租超过两千元，已经是一个相对明确的金额，且通常不会因金额过小而被法院拒绝立案。

2. 实际操作建议：

   • 保留证据：房东应保留好租房合同、租客拖欠房租的证据（如聊天记录、转账记录等），以便在提起诉讼时能够充分证明自己的主张。
   • 及时起诉：一旦发现租客拖欠房租，房东应及时与租客沟通协商，若协商无果，应及时向法院提起诉讼，以免超过诉讼时效。

3. 特殊情况说明：

   • 在某些特殊情况下，如果租客以非法占有为目的，拒不支付房租且数额较大，经房东多次催告后仍不支付，可能涉嫌侵占罪等刑事犯罪。但这种情况在实践中相对较少，且需要满足严格的条件，如侵占罪的数额较大标准可能因地区而异，一般需达到5000元至20000元以上（具体以当地司法规定为准）。不过，就您提出的情况，欠房租两千元通常不会构成刑事犯罪。

总结与建议： 在有租房合同的情况下，欠房租超过两千元，房东有权向法院提起诉讼来维护自己的合法权益。建议房东在提起诉讼前保留好相关证据，并及时与租客沟通协商。若协商无果，应及时向法院提起诉讼。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。