商标侵权撤店后，权利人仍然可以在一定期限内提起诉讼，这个期限通常是三年，且不受撤店行为本身直接影响。以下从几个关键角度为你详细分析：

一、诉讼时效的基本规定

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这一规定同样适用于商标侵权纠纷。因此，如果权利人在知道或者应当知道其商标权利受到损害以及义务人之日起三年内提起诉讼，其权利将受到法律的保护。撤店行为本身并不改变这一诉讼时效的起算点或期限。

二、超过诉讼时效的后果

1. 起诉权仍存在：即使超过了三年的诉讼时效期间，权利人仍然有权向法院提起诉讼，法院也会受理该案件。
2. 胜诉权可能丧失：然而，如果对方当事人以诉讼时效期间届满为由进行抗辩，并且法院查明不存在诉讼时效中止、中断或延长的事由，那么权利人可能会丧失胜诉权。这意味着，尽管案件被受理，但权利人可能无法通过诉讼获得法律强制力的保护，即无法获得赔偿或要求对方停止侵权等。

三、商标侵权的特殊性处理

商标侵权纠纷具有其特殊性。根据相关司法解释，如果商标注册人或者利害关系人超过三年提起诉讼，但在起诉时侵权行为仍在持续，并且该注册商标专用权仍在有效期限内，人民法院应当判决被告停止侵权行为。此外，侵权损害赔偿数额应当自权利人向人民法院起诉之日起向前推算三年计算。这一规定确保了即使在超过常规诉讼时效后，只要侵权行为仍在持续，权利人仍然有机会获得法律救济，即要求对方停止侵权行为，并可能获得一定期限内的赔偿。

四、实际建议

1. 及时收集证据：无论是否超过诉讼时效期间，权利人都应及时收集并保存相关证据。这些证据对于证明侵权行为的存在、确定赔偿数额以及支持权利人的主张都至关重要。证据可以包括侵权商品的照片、销售记录、广告宣传材料等。
2. 咨询专业律师：虽然我在这里为你提供了一些基本的法律知识和建议，但每个案件都有其独特性和复杂性。因此，在面临商标侵权问题时，建议你直接向我咨询，以便获取更具体、更个性化的法律建议和帮助。

举例说明：假设某商家在2020年侵犯了你的商标权，并在2021年撤店。如果你在2023年发现了这一侵权行为，并且该商标仍然有效，你仍然有权在2026年（即发现侵权行为之日起三年内）之前向法院提起诉讼，要求对方停止侵权行为并可能获得赔偿。如果侵权行为在2023年仍在持续，那么你的诉讼权利将得到更充分的保障。