建设工程合同纠纷的管辖规定主要依据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释来确定，具体规定如下：
一般地域管辖原则：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第二十四条的规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。这意味着，在建设工程合同纠纷中，原告可以选择向被告住所地或者合同履行地的人民法院提起诉讼。
专属管辖的特殊情况：
- 建设工程合同纠纷往往涉及不动产，根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十四条的规定，因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院专属管辖。在建设工程合同中，如果纠纷直接关联到工程本身（如工程质量、工程款支付等），则通常应由工程所在地的人民法院管辖。这一规定体现了对不动产纠纷处理的特殊性和专业性要求。
协议管辖的适用：
- 除了上述法定管辖原则外，根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十五条的规定，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。在建设工程合同中，双方当事人可以在合同中明确约定纠纷解决的地域管辖法院，只要该约定不违反级别管辖和专属管辖的规定，即具有法律效力。
在处理建设工程合同纠纷管辖问题时，还需注意以下几点：
- 准确识别纠纷性质：首先需要明确纠纷是否直接关联到工程本身，以确定是否适用专属管辖原则。如果纠纷主要涉及合同履行、款项支付等一般性问题，则可能适用一般地域管辖原则。
- 审查合同条款：仔细审查建设工程合同中的管辖条款，确认双方是否已有书面协议选择管辖法院。如有，则需判断该协议是否合法有效。
- 考虑实际联系地点：在协议管辖的情况下，需确保所选法院与争议有实际联系，如被告住所地、合同履行地等。避免选择与争议无实际联系的法院作为管辖法院。
举例说明：
假设甲公司（发包方）与乙公司（承包方）签订了一份建设工程合同，约定由乙公司在某地承建一项工程。后因工程款支付问题发生纠纷。在此情况下：
- 如果纠纷主要涉及工程款支付问题，且合同中未明确约定管辖法院，则甲公司可以选择向乙公司住所地或者合同履行地（即工程所在地）的人民法院提起诉讼。
- 如果合同中明确约定了纠纷解决的地域管辖法院（如甲公司所在地法院），且该约定不违反级别管辖和专属管辖的规定，则甲公司应按照合同约定向指定法院提起诉讼。
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