一天扣两天工资是否合法，这主要取决于扣工资的具体原因以及是否符合相关法律法规的规定。 以下从几个常见角度进行分析：

1. 基于公司规章制度：

   • 如果公司的规章制度中明确规定了，在特定情况下（如旷工、迟到早退达到一定次数等）可以扣除员工工资，并且这种规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照规章制度扣除工资可能是合法的。但一天扣两天工资的做法，通常需要规章制度中有特别明确且合理的依据，否则可能被视为不合理。
   • 规章制度必须经过民主程序制定，并且已经向员工公示或告知，否则可能因程序不合法而无效。

2. 基于劳动合同约定：

   • 如果劳动合同中明确约定了，在特定情况下公司可以扣除员工工资，并且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照合同约定扣除工资也是合法的。但同样，一天扣两天工资的约定需要特别明确且合理，否则可能被视为无效。

3. 基于法律法规规定：

   • 根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，公司不得无故克扣员工工资。如果公司因为员工的原因（如旷工、严重违反公司规章制度等）需要扣除工资，也应当遵循合法、合理、公正的原则，并且扣除的金额不得超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。一天扣两天工资的做法，很可能超出了法律法规规定的扣除比例和范围，因此可能是不合法的。

4. 特殊情况下的工资扣除：

   • 在某些特殊情况下，如员工给公司造成经济损失、违反竞业限制协议等，公司可能需要扣除员工工资作为赔偿或违约金。但即使在这种情况下，扣除的金额也应当合理，并且需要遵循相关法律法规的规定。一天扣两天工资的做法，同样需要特别谨慎，并确保符合法律法规的要求。

建议：

• 如果你认为公司扣除工资的做法不合理或违法，可以先与公司进行沟通协商，要求公司说明扣除工资的具体原因和依据。
• 如果沟通无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

总结：一天扣两天工资的做法是否合法，需要综合考虑公司规章制度、劳动合同约定以及相关法律法规的规定。在大多数情况下，这种做法可能缺乏合理依据或违反了法律法规的强制性规定，因此可能是不合法的。如果你对此有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。