全屋家具定做先付款90%（推测为90%的款项）是否合法，需结合具体情形判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 合同自由原则角度
   根据《民法典》第四百七十条，合同内容由当事人约定，包括价款、支付方式等条款。若消费者与商家在定做合同中明确约定“先支付90%款项”，且双方自愿签署、无欺诈胁迫情形，该条款原则上有效。但需注意：
   

• 若商家未履行主要义务（如未开始生产、未交付家具），消费者已支付大额款项，可能面临资金安全风险；
  
• 若合同未明确约定付款与交付的对应关系（如剩余10%何时支付），可能引发纠纷。

1. 消费者权益保护角度
   根据《消费者权益保护法》第十六条、第二十六条，商家不得设定不公平、不合理的交易条件。若“先付90%”导致消费者权益显著失衡（如商家拖延交付、质量不达标且拒不退款），可能被认定为“霸王条款”，消费者可主张撤销或变更合同。
   建议：消费者可要求商家在合同中明确约定付款与交付的节点（如“定金30%、验收合格后付60%、安装完成后付10%”），并保留付款凭证、沟通记录等证据。

2. 定金规则角度
   若“90%款项”性质为定金，根据《民法典》第五百八十六条，定金数额不得超过主合同标的额的20%，超过部分不产生定金效力。例如，若合同总价10万元，定金最高2万元，剩余7万元需以其他名义（如预付款）支付，否则超出部分可能被要求返还。

行动建议：

• 签署合同前，要求商家明确款项性质（定金/预付款/进度款）及支付条件；
  
• 避免一次性支付大额款项，可约定分期支付（如按生产进度、交付节点付款）；
  
• 若已支付且商家违约，可依据合同约定主张违约责任，或向市场监管部门投诉、通过诉讼解决。
  

如有具体合同条款或纠纷细节，可进一步向我咨询。