事业单位职工因违反院纪被待岗处理时，工资发放需根据具体情况确定，通常有以下两种处理方式：

1. 待岗期间工资发放标准
   根据《事业单位人事管理条例》及相关地方规定，若职工因违纪被安排待岗，单位需按不低于当地最低工资标准支付基本生活费。具体比例可能因单位内部规章制度或地方政策而异，例如部分地区规定待岗期间工资为原工资的70%-80%，但不得低于最低工资标准。若单位规章制度中明确规定了待岗工资标准，且该制度经民主程序制定并公示，则可按制度执行。

2. 违纪情节与工资扣减的关联性
   若违纪行为严重（如旷工、严重失职等），单位可能依据《事业单位工作人员处分暂行规定》给予警告、记过、降低岗位等级等处分。此时，工资扣减需与处分类型匹配：

   • 警告处分：通常不影响工资，但可能影响绩效或奖金；
     
   • 记过及以上处分：可能扣减部分绩效工资或津贴，具体幅度需参照单位内部规定；
     
   • 降低岗位等级：工资按新岗位标准发放。
     需注意：单位不得以“待岗”为由变相克扣工资，扣减部分需有明确依据且合理。

建议行动：

• 核实单位《员工手册》或规章制度中关于待岗及工资发放的条款；
  
• 若单位扣减工资无依据或低于最低标准，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁；
  
• 保留待岗通知、工资条等证据，以便维权时使用。
  

如有进一步疑问（如具体地区政策、单位规章制度合法性等），可直接向我咨询。