在处理假冒商标罪中员工知情的情况时，我们需要综合考虑多个方面，包括员工的主观故意、实际行为、在犯罪中所起的作用以及犯罪情节的严重程度。以下是对此问题的详细解答：
一、员工是否构成犯罪
主观故意：
- 员工必须明知公司或单位在实施假冒注册商标的行为，并基于此故意继续参与。如果员工确实不知情，且在日常工作中无理由应当知道，那么他们通常不构成犯罪。但这种情况较为少见，因为假冒商标罪通常要求主观上的故意。
实施犯罪行为：
- 员工需客观上实施了与假冒注册商标直接相关的行为，如生产、销售、使用假冒商标等。如果员工只是按正常工作安排履行职责，没有直接参与假冒行为，那么他们可能不构成犯罪。
二、量刑考量因素
如果员工构成假冒商标罪，法院将依据以下因素进行量刑：
在犯罪中所起的作用：
- 主犯：对于策划、组织犯罪活动或在生产、销售等关键环节起主导作用的员工，将被认定为主犯。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，他们可能面临三年以下有期徒刑并处罚金，或者三年以上十年以下有期徒刑并处罚金，具体取决于犯罪情节的严重程度。
- 从犯：对于在犯罪中起次要或辅助作用的员工，如负责搬运、简单包装等，将被认定为从犯。对于从犯，法律规定应当从轻、减轻处罚或者免除处罚。
犯罪情节严重程度：
- 法院会考虑非法经营数额、违法所得数额等情节来判定犯罪的严重程度。例如，非法经营数额在五万元以上或违法所得数额在三万元以上等情形，一般处三年以下有期徒刑并处罚金；而非法经营数额在二十五万元以上或违法所得数额在十五万元以上等情形，则可能面临三年以上十年以下有期徒刑并处罚金。
三、员工自我保护与应对建议
尽早咨询专业律师：
- 如果员工涉嫌假冒商标罪，应尽早咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的法律后果。
积极配合调查：
- 员工应积极配合相关部门的调查，如实陈述事实，提供相关证据。
提供充分证据证明不知情：
- 如果员工确实对假冒行为不知情，应尽可能提供充分证据来证明自己的清白，如工作记录、同事证言等。
提高警惕，避免卷入违法行为：
- 员工在日常工作中应提高警惕，确保不参与任何违法活动，特别是与假冒商标相关的行为。
四、公司层面的预防措施
加强员工培训：
- 公司应定期对员工进行知识产权和商标法培训，提升员工的法律意识和风险防范能力。
严格内部管理：
- 建立健全的内部管理制度，加强对采购、生产、销售等环节的监管，确保商品来源合法、质量可靠。
建立举报机制：
- 鼓励员工积极举报违法行为，对举报人给予适当奖励和保护，形成有效的内部监督机制。
综上所述，对于假冒商标罪中员工知情的情况，我们需要综合考虑多方面因素来确定员工是否构成犯罪以及量刑的轻重。员工应明确自身责任与义务，避免卷入违法行为之中；同时，公司也应加强内部管理和员工培训，以预防类似事件的发生。