若“两田制”实施过程中确实存在剥夺农民承包权的违法行为，农民可通过协商、投诉举报、申请行政复议、提起行政诉讼或民事诉讼等途径维护自身权益。以下是对此问题的详细分析：

一、明确“两田制”与农民承包权的关系

“两田制”通常指的是将农田分为口粮田和责任田两部分进行管理的一种制度。在合法合规的“两田制”下，农民的承包权应得到充分保障，包括承包地的使用权、收益权和流转权等。若“两田制”的实施过程中存在剥夺农民承包权的行为，则可能涉及违法。

二、分析剥夺农民承包权的具体情形

剥夺农民承包权可能表现为多种形式，如：

1. 未经法定程序收回承包地：根据《中华人民共和国农村土地承包法》的相关规定，承包期内，发包方不得收回承包地。若发包方未经法定程序，如未经村民会议或村民代表会议讨论决定，擅自收回承包地，则构成违法行为。
2. 强制流转承包地：若发包方或第三方未经农民同意，强制流转其承包地，也构成对农民承包权的剥夺。
3. 其他侵犯承包权的行为：如擅自改变承包地的用途、破坏承包地等，也可能间接剥夺农民的承包权。

三、农民应如何维护自身权益

针对剥夺农民承包权的行为，农民可以采取以下措施维护自身权益：

1. 与发包方协商：

   • 农民可以首先尝试与发包方进行协商，表达自身诉求，要求恢复承包权或获得相应补偿。

2. 向相关部门投诉举报：

   • 若协商无果，农民可以向当地农村土地承包仲裁委员会申请仲裁，或向农业农村主管部门、乡镇人民政府等投诉举报。
   • 投诉举报时，应提供相关证据材料，如承包合同、土地权属证明、侵权行为照片或视频等。

3. 申请行政复议或提起行政诉讼：

   • 若农民认为行政机关的具体行政行为侵犯了其承包权，如行政机关作出的收回承包地的决定等，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。

4. 提起民事诉讼：

   • 若发包方或第三方的侵权行为构成民事侵权，农民可以依法向人民法院提起民事诉讼，要求停止侵害、恢复原状、赔偿损失等。

四、注意事项

1. 保留证据：

   • 农民在维护自身权益的过程中，应注重保留相关证据材料，如承包合同、土地权属证明、侵权行为照片或视频、协商记录、投诉举报材料等。

2. 及时行动：

   • 农民在发现承包权被剥夺后，应及时采取行动，避免错过维权时机。

3. 寻求法律援助：

   • 若农民在维权过程中遇到困难或疑问，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以获取更专业的法律帮助。