针对“处罚后持续非法占有农耕地是否会面临二次处罚”的问题，结论如下：

1. 若原处罚未有效制止非法占有行为，且行为持续存在，则可能面临二次处罚：

   • 法律背景：根据《土地管理法》第七十七条，未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地。若行为人未在规定期限内退还，且持续非法占有农耕地，这表明原处罚并未有效制止其违法行为。
   • 法律后果：在此情况下，自然资源主管部门有权依据相关法律法规，对行为人进行二次处罚，包括但不限于罚款、没收违法所得、责令限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施等。若行为构成犯罪，还将依法追究刑事责任。

2. 二次处罚的合法性与合理性：

   • 合法性：二次处罚的合法性基于行为人持续违法的状态。只要行为人的非法占有行为未得到纠正，且持续存在，自然资源主管部门就有权依法进行处罚，以维护土地管理秩序和公共利益。
   • 合理性：从合理性角度来看，二次处罚旨在通过经济手段或其他强制措施，促使行为人停止违法行为，恢复土地原状。这有助于保护农耕地的合法使用，防止土地资源的浪费和破坏。

3. 行为人应采取的措施：

   • 立即停止违法行为：行为人应认识到非法占有农耕地的严重性，立即停止违法行为，并主动退还非法占用的土地。
   • 配合调查与处理：在自然资源主管部门进行调查时，行为人应积极配合，提供相关证据和信息，以便主管部门准确判断违法事实，并作出合理的处罚决定。
   • 寻求法律救济：若行为人对处罚决定有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。

法律建议：

• 行为人应严格遵守土地管理法律法规，不得非法占用农耕地。若已非法占用，应立即停止违法行为，并主动退还土地，以避免面临更严重的法律后果。
• 自然资源主管部门在处罚非法占有农耕地行为时，应确保处罚的合法性和合理性，充分保障行为人的合法权益。同时，应加强对土地资源的监管和保护，防止类似违法行为的再次发生。

可能面临的法律后果示例：

• 假设行为人因非法占用农耕地被处以罚款，但未在规定期限内缴纳罚款且持续非法占有土地。在此情况下，自然资源主管部门有权依法加处罚款，并可能采取其他强制措施，如查封、扣押财物等，以迫使行为人履行处罚决定。若行为人仍不履行，还可能面临被强制执行的风险。