关于电动摩托车更换控制器是否违法的问题，这主要取决于更换控制器的具体情况和相关法律法规的遵守情况，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：

1. 合法更换的情况：

   • 如果电动摩托车的控制器因故障或损坏需要更换，且更换的控制器是符合国家相关标准、质量合格的配件，同时更换过程由专业人员进行，确保不会影响车辆的安全性能，那么这种更换是合法的。
   • 在更换控制器时，如果车主能够保留好更换前的旧控制器以及更换时的相关凭证（如购买发票、维修记录等），以便在需要时证明更换的合法性和合规性，这也是非常重要的。

2. 可能违法的情况：

   • 非法改装：如果更换的控制器并非原厂配件，且更换后导致电动摩托车的性能（如速度、功率等）超出国家相关标准，或者改变了车辆的原设计结构，那么这种更换可能构成非法改装，是违法的。非法改装不仅可能面临交警的处罚，还可能影响车辆的保险理赔和年检。
   • 无资质更换：如果更换控制器的工作由无资质的人员进行，且更换过程中存在安全隐患或未按照规范操作，那么这种更换也是不合法的。车主应选择有资质的维修店或专业人员进行更换。
   • 未报备或登记：在某些地区，对电动摩托车的改装或更换重要部件可能有报备或登记的要求。如果车主未按照当地规定进行报备或登记，那么即使更换的控制器是合法的，也可能因未履行相关手续而面临处罚。

法律建议：

• 在更换电动摩托车控制器前，车主应先了解当地的相关法律法规和规定，确保更换行为合法合规。
• 选择有资质、信誉好的维修店或专业人员进行更换，确保更换过程的安全性和合规性。
• 保留好更换前的旧控制器以及更换时的相关凭证，以备不时之需。
• 如果对更换控制器是否合法存在疑问，可以向当地交警部门或相关法律机构咨询，以获取准确的法律意见。

可能后果：

• 如果更换控制器构成非法改装或未履行相关手续，车主可能面临交警的处罚，包括罚款、扣车等。
• 非法改装还可能影响车辆的保险理赔和年检，给车主带来不必要的麻烦和损失。

总之，电动摩托车更换控制器是否违法取决于多种因素。车主在更换前应充分了解相关法律法规和规定，确保更换行为合法合规，以避免不必要的法律风险和损失。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。