有行政处罚的企业在符合一定条件下仍可申请专精特新认定，但需根据处罚类型、整改情况及认定政策综合判断。以下是具体分析：

1. 行政处罚类型与影响程度
   专精特新认定通常要求企业具备“良好的经营状况和信用记录”。若行政处罚涉及重大违法违规行为（如严重环境污染、偷税漏税、安全生产事故等），可能直接导致认定失败；若为一般性行政处罚（如轻微环保超标、未及时年报等），且已整改完毕，通常不影响申请。

2. 整改与信用修复要求
   根据《市场监督管理信用修复管理办法》，企业完成行政处罚整改后，可通过信用修复程序移除处罚记录（如公示期满后申请提前停止公示）。若处罚记录已从公开渠道移除，认定机构可能无法查询到，此时不影响申请；若未修复，需在申报材料中如实说明处罚情况及整改措施。

3. 地方政策差异
   部分省份对专精特新认定的“信用门槛”有细化规定。例如：

   • 北京市：要求企业近3年无重大安全、质量、环境污染事故，无严重失信行为；
     
   • 广东省：明确“被列入经营异常名录或严重违法失信企业名单”的企业不得申报，但未限制一般行政处罚；
     
   • 江苏省：允许企业通过信用修复后申请，但需提供整改证明。
     建议：直接查询目标省份的《专精特新企业认定管理办法》或咨询当地工信部门，确认具体要求。

4. 申报材料中的披露义务
   即使行政处罚已整改完毕，企业仍需在申报材料中主动披露处罚信息，并附上整改证明（如罚款缴纳凭证、整改验收报告等）。隐瞒处罚记录可能导致认定资格取消，甚至被列入失信名单。

行动建议：

1. 核对行政处罚决定书，确认处罚类型及整改要求；
   
2. 联系当地工信部门或认定机构，确认处罚是否属于“一票否决”情形；
   
3. 若处罚可修复，尽快完成信用修复程序；
   
4. 在申报材料中如实说明情况，突出整改成效和企业合规经营能力。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体省份的政策细节或材料准备要点。