针对员工提出离职时如何处理合同问题，核心结论需分情况讨论，具体如下：
员工主动提出离职且符合法定程序
若员工依据《劳动合同法》第37条提前30日（试用期提前3日）书面通知用人单位解除劳动合同，用人单位应：
- 确认离职日期：以书面形式回复员工，明确最后工作日及工作交接要求；
- 结算工资及经济补偿：在离职当日一次性结清工资，若涉及经济补偿（如用人单位存在未缴社保、拖欠工资等情形），需按工作年限支付（每满1年支付1个月工资）；
- 出具离职证明：根据《劳动合同法》第50条，用人单位必须在解除劳动合同时出具书面证明，内容需包含劳动合同期限、工作岗位、工作年限等信息；
- 办理档案和社保转移：协助员工办理档案转移、社保关系封存或转移手续，避免因拖延导致员工无法享受社保待遇。
员工未提前通知或违反合同约定离职
若员工未履行法定通知义务或违反保密协议、竞业限制等约定，用人单位可：
- 要求赔偿损失：根据《劳动合同法》第90条，若员工违法解除劳动合同给用人单位造成损失（如招聘成本、培训费用、项目中断损失等），可要求员工赔偿，但需承担举证责任；
- 追究违约责任：若劳动合同中约定了服务期或竞业限制条款，员工违反的需支付违约金（违约金数额不得超过用人单位提供的培训费用或竞业限制经济补偿的3倍）；
- 拒绝支付经济补偿：若员工因个人原因主动离职（非用人单位过错），用人单位无需支付经济补偿，但需注意避免被认定为“违法解除”而承担双倍赔偿风险。
用人单位存在过错导致员工离职
若员工因用人单位未提供劳动条件、未及时支付劳动报酬、未依法缴纳社保等情形提出离职，用人单位需：
- 支付经济补偿：按员工工作年限支付经济补偿（每满1年支付1个月工资，6个月以上不满1年按1年计算，不满6个月支付半个月工资）；
- 补缴社保及公积金：若存在未缴或欠缴情形，需为员工补缴，否则可能面临行政处罚；
- 避免被认定为“违法解除”：若员工以“被迫离职”为由主张赔偿，用人单位需提供证据证明自身无过错，否则可能被认定为违法解除，需支付双倍经济补偿。
实务建议：
- 用人单位应完善离职管理制度，明确离职流程、交接要求及违约责任，避免因程序瑕疵引发纠纷；
- 员工提出离职时，用人单位需及时沟通，了解离职原因，若因自身过错导致员工离职，应主动协商解决，降低法律风险；
- 双方均需保留书面证据（如离职申请、回复函、工资结算单等），以便在纠纷中维护自身权益。
如有具体合同条款或离职情形需要分析，可直接向我咨询。