关于小诊所治疗脑梗死是否合法的问题，这需要从多个方面进行详细阐述。

首先，我们需要明确的是，任何医疗机构，包括小诊所，要合法开展诊疗活动，必须满足一定的条件。这些条件包括但不限于：拥有合法的医疗机构执业许可证、具备相应的医疗设施和设备、拥有合格的医疗人员（如执业医师、护士等），并且这些医疗人员需要在其注册的执业范围内进行诊疗活动。

对于脑梗死这种严重的疾病，其治疗通常需要较高的医疗技术和设备支持，以及专业的医疗团队进行协作。小诊所如果缺乏相应的医疗设施、设备或专业医疗人员，那么其治疗脑梗死的行为就可能存在合法性风险。

进一步地，根据国家卫生健康委、中医药局等相关部门的通知和规定，严禁无资质机构和人员提供医疗服务。这意味着，如果小诊所没有合法的医疗机构执业许可证，或者其医疗人员没有相应的执业资质，那么其提供脑梗死治疗服务就是违法的。

此外，即使小诊所有合法的执业许可证和合格的医疗人员，也需要确保其诊疗活动在注册的执业范围内进行。如果小诊所的医疗人员超出了其注册的执业范围进行脑梗死治疗，那么这种行为也是违法的。

对于违反规定的行为，相关部门将按照《执业医师法》、《医疗机构管理条例》等有关法律法规进行处理，涉嫌犯罪的，还将依法移送司法机关。

综上所述，小诊所治疗脑梗死是否合法，取决于其是否满足合法的医疗机构执业条件、是否拥有合格的医疗人员、是否在其注册的执业范围内进行诊疗活动等多个因素。因此，在选择小诊所进行脑梗死治疗时，患者应谨慎考虑，并尽可能选择具备合法资质和较高医疗水平的医疗机构进行治疗。同时，相关部门也应加强监管力度，确保医疗市场的合法性和安全性。