结论：房东店铺被法院拍卖后，与原房东签订的合同是否有效，需根据合同类型及具体情况来判断，一般情况下，租赁合同在有效期内且未被解除或宣告无效的，仍然有效；买卖合同则可能因拍卖导致合同目的无法实现而面临解除或无效的风险。
分析：
租赁合同的情况：
- 合同效力：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，租赁物在承租人按照租赁合同占有期限内发生所有权变动的，不影响租赁合同的效力。这意味着，即使房东的店铺被法院拍卖，新的所有权人（买受人）需继续履行原租赁合同，除非合同中有特别约定或法律另有规定。
- 例外情况：如果租赁合同中存在违法条款，或者合同因欺诈、胁迫等原因被宣告无效，那么合同自然无效。此外，如果租赁期限超过了法律规定的上限（如住宅租赁不得超过二十年），超出部分也将被视为无效。
- 建议：对于承租人而言，应仔细审查租赁合同，确保合同内容合法且未超过法定租赁期限。在房东店铺被拍卖后，及时与新的所有权人沟通，确认租赁合同的继续履行情况。
买卖合同的情况：
- 合同效力与履行：如果与原房东签订的是买卖合同，且合同尚未履行完毕（如尚未办理过户手续），那么房东店铺被法院拍卖可能导致合同目的无法实现。根据《中华人民共和国民法典》的规定，因不可抗力致使不能实现合同目的，当事人可以解除合同。在此情况下，买受人可以与原房东协商解除合同，并要求返还已支付的款项及赔偿损失。
- 拍卖程序的影响：在拍卖程序中，如果买受人通过合法途径竞得店铺，且拍卖公告中已明确告知店铺存在买卖合同纠纷等风险，那么买受人通常需自行承担这些风险。然而，如果原房东在拍卖过程中存在欺诈、隐瞒等行为，导致买受人遭受损失，买受人可以依法追究原房东的责任。
- 建议：对于买受人而言，在签订买卖合同前应充分了解店铺的权属状况及可能存在的风险。在房东店铺被拍卖后，及时与拍卖机构、原房东及新的所有权人沟通，了解合同履行情况及后续处理方案。
综合建议：
- 在面对房东店铺被法院拍卖的情况时，无论是承租人还是买受人，都应首先审查与原房东签订的合同内容，了解合同类型、期限及双方的权利义务。
- 及时与新的所有权人、拍卖机构及原房东沟通，了解合同履行情况及后续处理方案。
- 如遇合同纠纷或法律问题，建议及时咨询专业律师（即我本人，游本刚律师，专注于刑事辩护、知识产权、房产纠纷、民间借贷、法律顾问、海事商事领域），以便更好地维护自身合法权益。