当您被认定为全责，而对方是营运车辆时，赔偿问题确实需要细致且全面地考虑。首先，可以明确的是，保险公司会在其保险责任范围内进行赔偿，但具体赔偿项目和流程需要您仔细了解。
一、赔偿项目
车辆直接损失：
- 这包括被损坏车辆的维修费用以及车辆所载物品的损失费用。保险公司会根据车辆的实际损失情况进行评估，并支付相应的维修费用，以恢复车辆至正常营运状态。
- 如果车辆因事故无法修复，保险公司会支付与被损坏车辆价值相当的车辆重置费用。
营运损失：
- 停运损失：营运车辆在事故后到修复期间无法正常从事营运活动，因此会产生预期利益损失。这部分损失需要根据车辆以往的营运收入记录来计算，如出租车公司的每日载客收入统计或货运公司的运输合同及收入明细。如果无法提供准确收入记录，可以参考同地区、同类型营运车辆的平均收入水平。
- 司机误工费：如果司机因事故受伤或需要处理事故相关事宜而无法工作，也会产生误工费。这部分费用根据司机的实际收入情况来计算，有固定收入的按实际减少的收入计算，无固定收入的则参照相关行业标准。
其他相关费用：
- 这包括施救费用（如拖车费）、替代性交通工具费用（车辆维修或重置期间因无法使用而产生的替代交通工具的合理费用）以及租赁替代车辆费用（在营运车辆无法使用期间，租赁其他车辆进行营运所产生的租赁费用）。
人身损害赔偿（如适用）：
- 如果营运车辆的司机或乘客在事故中受伤，您还需要赔偿医疗费、误工费、护理费等各类人身损害赔偿费用。具体计算方式和标准依据相关法律法规确定。
二、赔偿流程
收集证据：
- 您需要收集事故责任认定书、车辆维修发票、营运收入流水、施救费用发票、租赁替代车辆合同及费用发票等证据，以全面证明损失情况。
- 同时，您还需要提供车辆的营运证件，如道路运输许可证、从业资格证等，以证明车辆合法从事营运活动。
协商赔偿：
- 在收集好证据后，您可以与对方及其保险公司就赔偿事宜进行协商。在协商过程中，您需要清晰说明赔偿依据和计算方法，并争取达成一致的赔偿协议。
提起诉讼（如协商无果）：
- 如果协商无果，您可以向事故发生地或被告所在地的人民法院提起民事诉讼。
- 在诉讼过程中，您需要确保提供的证据真实、合法、关联，并积极配合法院的审理工作。法院将根据双方证据和相关法律规定对赔偿问题进行审理和判决。
三、保险公司的作用
在整个赔偿过程中，保险公司会扮演重要角色。他们会在其保险责任范围内对您的损失进行评估，并支付相应的赔偿款项。但是，需要注意的是，保险公司可能不会承担所有损失，特别是当损失超出保险责任范围或存在免赔条款时。因此，在协商和诉讼过程中，您需要充分了解保险条款和保险责任范围，以确保自己的合法权益得到充分保障。
综上所述，当您被认定为全责且对方是营运车辆时，赔偿问题需要细致且全面地考虑。通过收集证据、协商赔偿和提起诉讼等流程，您可以确保自己的合法权益得到充分保障。同时，与保险公司的沟通和配合也是非常重要的。