关于企业在员工笔记本中安装VPN是否合法的问题，这主要取决于VPN的使用目的和方式。

首先，我们需要明确的是，根据工业和信息化部印发的《关于清理规范互联网网络接入服务市场的通知》中的相关规定，未经电信主管部门批准，不得自行建立和租用专线（含虚拟专用网络VPN）等其他信道开展跨境经营活动。这一规定主要是针对未经批准、无国际通信业务经营资质的企业或个人，私自开展跨境的电信业务经营活动的情况。

对于企业而言，如果其安装VPN的目的是为了办公自用，例如访问公司内部的网络资源、进行远程办公等，并且这种使用是合法的、经过电信主管部门批准的，那么这种安装和使用行为是合法的。具体来说，外贸企业、跨国企业因办公自用等原因，需要通过专线等方式跨境联网时，可以向依法设置国际通信出入口局的电信业务经营者租用，这是被允许的。

然而，如果企业未经批准，私自安装和使用VPN进行跨境经营活动，或者利用VPN进行非法活动，如访问被禁止的网站、传输非法信息等，那么这种行为就是违法的，可能会受到相关法律法规的制裁。

此外，虽然您提供的参考信息中主要涉及的是《关于清理规范互联网网络接入服务市场的通知》和《区块链信息服务管理规定》，但后者主要规范的是区块链信息服务活动，与VPN的合法性无直接关联。不过，从更广泛的角度来看，任何网络信息服务活动都需要遵守国家的相关法律法规，确保网络信息的安全和合法使用。

综上所述，企业在员工笔记本中安装VPN的合法性取决于其使用目的和方式。如果是为了合法的办公自用，并且经过了电信主管部门的批准，那么是合法的；否则，就是违法的。因此，建议企业在安装和使用VPN时，务必遵守国家的相关法律法规，确保合法合规。