在处理遗产继承纠纷中，当股权所在地与不动产所在地不一致时，确定管辖法院需要综合考虑多个因素，以下是对此问题的详细解答：
一、基本原则
根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，遗产继承纠纷案件的管辖法院主要由被继承人死亡时的住所地或主要遗产所在地人民法院专属管辖。这是确定管辖法院的基本原则。
二、被继承人死亡时住所地的确定
- 住所地定义：通常指被继承人的户籍所在地。
- 经常居住地与户籍所在地不一致：若被继承人在死亡前已在某一地点连续居住一年以上（住院就医除外），则该地点视为其经常居住地，并作为确定管辖的住所地。
三、主要遗产所在地的确定（针对股权与不动产不一致的情况）
股权作为主要遗产：
- 如果股权在遗产中占据主导地位，即其价值远超其他遗产（包括不动产），那么股权所在地（通常为公司住所地）可能被视为主要遗产所在地。
- 在这种情况下，股权继承案件通常由公司住所地人民法院管辖，因为公司的各类文件、财务资料等通常存放于公司住所地，由该地法院管辖有利于快速、全面地获取案件相关证据。
不动产作为主要遗产：
- 如果不动产在遗产中占据主导地位，即其价值远超其他遗产（包括股权），那么不动产所在地将被视为主要遗产所在地。
- 根据不动产专属管辖原则，无论其他遗产分布情况如何，均由不动产所在地法院专属管辖。
股权与不动产价值相当：
- 如果股权与不动产在遗产中的价值相当，难以确定哪一个是主要遗产，那么可能需要考虑其他因素，如遗产的分布情况、当事人的便利性等。
- 在这种情况下，各遗产所在地的法院可能均享有管辖权，原告可以选择其中一个法院提起诉讼。
四、特殊情况的处理
- 级别管辖：在确定具体管辖法院时，还需考虑级别管辖问题。一般而言，基层人民法院管辖一般的遗产继承案件；若案件涉及标的额较大、复杂程度较高或具有重大影响，则可能由中级人民法院甚至高级人民法院管辖。
- 协议管辖：如果当事人之间存在有效的书面管辖协议，并且该协议不违反级别管辖和专属管辖规定的，应按照协议约定确定管辖法院。但这一点在遗产继承纠纷中较为少见，因为当事人通常不会在继承前就管辖问题达成协议。
五、建议与注意事项
- 咨询专业律师：鉴于遗产继承纠纷的复杂性和敏感性，建议当事人在遇到相关问题时及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见并有效维护自身权益。
- 准备充分证据：提起诉讼时，需向人民法院递交起诉状及相关证据材料，包括但不限于继承人的身份证件、亲属关系证明、被继承财产的证明文件（如房产证、股权证明等）、被继承人的死亡证明等。
- 选择正确法院：原告应在有管辖权的法院中选择一个提起诉讼，确保诉讼的顺利进行。如果选择错误，可能会导致案件被驳回或移送其他法院处理，从而增加诉讼成本和时间。
综上所述，当股权所在地与不动产所在地不一致时，确定遗产继承纠纷的管辖法院需要综合考虑多个因素。建议当事人在遇到此类问题时及时咨询专业律师，并根据具体情况选择合适的管辖法院提起诉讼。