结论：工资跨行扣手续费是否合法，需分情况讨论，具体如下：

1. 若手续费扣除未经劳动者同意：

   • 法律分析：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。若用人单位未经劳动者同意，擅自扣除跨行转账手续费，这实际上构成了对劳动者工资的克扣，违反了上述法律规定。
   • 建议：劳动者有权要求用人单位全额支付工资，并可以就此事向当地劳动监察部门投诉，以维护自己的合法权益。

2. 若手续费扣除经劳动者同意，且符合双方约定：

   • 法律分析：如果用人单位与劳动者在劳动合同或相关协议中明确约定了跨行转账手续费的承担方式，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位扣除手续费的行为可能是合法的。但需要注意的是，这种约定应当是双方真实意思的表示，且不得损害劳动者的合法权益。
   • 建议：劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资支付和费用扣除的部分。如果对于手续费扣除有疑问或不满，应及时与用人单位沟通并协商解决。

3. 特殊情况下的手续费扣除：

   • 法律分析：在某些特殊情况下，如用人单位因经营需要必须使用跨行转账方式支付工资，且该转账方式确实产生了额外费用，那么用人单位可能会与劳动者协商分担这部分费用。但即便如此，用人单位也应当确保扣除的费用合理且必要，并不得违反法律法规的强制性规定。
   • 建议：在特殊情况下，劳动者应与用人单位充分沟通，了解手续费扣除的具体原因和依据。如果认为扣除的费用不合理或存在争议，可以寻求法律援助或向劳动监察部门投诉。

进一步思考：

• 劳动者在面对工资跨行扣手续费的问题时，应首先了解自己的权益和法律法规的相关规定。
• 如果对于手续费扣除有疑问或不满，应及时与用人单位沟通并协商解决。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
• 用人单位在扣除手续费时，应确保扣除的费用合理且必要，并遵守相关法律法规的规定，以避免引发劳动争议和法律风险。

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