结论：乙方是否违法，关键在于双方约定的利息是否超过了法律规定的上限。若超过，则超过部分的利息约定无效，乙方可能涉及违法收取高额利息；若未超过，则乙方不违法。

分析如下：

1. 法律规定：

   • 根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，借贷双方约定的利率未超过合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）的四倍，出借人请求借款人按照约定的利率支付利息的，人民法院应予支持。
   • 如果借贷双方约定的利率超过合同成立时一年期贷款市场报价利率四倍，超过部分的利息约定无效。借款人请求出借人返还已支付的超过部分的利息的，人民法院应予支持。

2. 利息计算与对比：

   • 假设当前一年期贷款市场报价利率（LPR）为X%（具体数值需根据最新数据确定，此处仅为示例），则法律允许的最高年利率为4X%。
   • 三年总利息上限计算：\(50万 \times 4X\% \times 3年 = 60万 \times X\%\)（以X%为具体LPR利率计算得出的三年总利息上限的百分比形式，实际需代入具体LPR数值）。若以常见的LPR数值（如3.85%）代入，则三年总利息上限约为\(50万 \times 4 \times 3.85\% \times 3 = 23.1万\)（此数值为示例，实际需根据最新LPR计算）。
   • 用户提到三年时间还款利息将近一百万，这明显超过了按照当前LPR四倍计算出的利息上限。

3. 法律后果：

   • 如果乙方收取的利息超过了法律规定的上限，那么超过部分的利息约定是无效的。甲方有权要求乙方返还已支付的超过部分的利息。
   • 如果乙方坚持收取高额利息，可能构成违法收取高额利息的行为，甲方可以向相关部门投诉或提起诉讼来维护自己的合法权益。

建议：

• 甲方应首先核对双方签订的借款合同，确认约定的利率是否超过了法律规定的上限。
• 如果超过了上限，甲方可以与乙方协商，要求降低利息或返还已支付的超过部分的利息。
• 如果协商无果，甲方可以向当地金融监管部门投诉或向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

进一步思考：

• 在实际操作中，除了利息问题外，还需要关注借款合同的其他条款是否合法合规，如还款方式、违约责任等。
• 如果借款合同中存在其他违法或显失公平的条款，甲方也可以一并提出异议并寻求法律救济。

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