核心结论：公司未按补偿协议约定时间支付补偿款，违约金的计算需依据协议具体条款、实际损失情况及法律规定综合判断，具体分以下几种情况：

1. 协议有明确违约金条款
   若补偿协议中明确约定了逾期支付的违约金计算方式（如按日支付未付金额的0.05%作为违约金），则直接按协议约定执行。例如：协议约定“逾期每日按未付金额的0.1%支付违约金”，公司拖欠10万元补偿款30天，则违约金为10万×0.1%×30=3000元。
   注意：若违约金过高（超过实际损失的30%），公司可能以“显失公平”为由要求法院调整；若过低，您可主张按实际损失（如利息损失、维权成本等）补足。

2. 协议未约定违约金，但约定了逾期利息
   若协议未明确违约金，但约定了逾期利息（如“逾期按LPR利率支付利息”），则可按约定主张利息。例如：协议约定“逾期按全国银行间同业拆借中心公布的LPR利率支付利息”，公司拖欠10万元补偿款1年，若当年LPR为3.85%，则利息为10万×3.85%=3850元。

3. 协议未约定违约金或逾期利息
   若协议完全未约定逾期责任，您可主张公司赔偿实际损失，包括：

   • 资金占用损失：按同期银行贷款利率或LPR利率计算利息；
     
   • 维权成本：如律师费、诉讼费、差旅费等（需保留票据）；
     
   • 其他直接损失：如因公司逾期支付导致您产生的额外费用（需举证）。
     示例：公司拖欠10万元补偿款导致您需借款周转，产生利息5000元，则可主张赔偿5000元。

行动建议：

1. 核查协议条款：优先按协议约定主张违约金或利息；
   
2. 收集证据：保留协议原件、公司逾期未支付的凭证（如银行流水、催款记录）；
   
3. 协商或诉讼：先与公司协商补付，若协商无果，可向法院起诉要求支付补偿款、违约金及实际损失。
   

提示：违约金与赔偿损失不可同时主张，若协议违约金低于实际损失，可要求按实际损失赔偿；若高于实际损失，公司可能要求调减。具体操作需结合协议内容及证据情况，如有疑问可进一步向我咨询。