诉讼时效过后，抵押权本身并不消灭，但抵押权人会丧失通过人民法院司法强制保护实现抵押权的权利。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与规定
《中华人民共和国民法典》的相关规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。超过二十年的人民法院不予保护，特殊情况下可申请延长。
- 根据《中华人民共和国民法典》第四百一十九条，抵押权人应当在主债权诉讼时效期间行使抵押权；未行使的，人民法院不予保护。这一条款明确了抵押权的行使期限与主债权的诉讼时效相关联，但并未直接规定债权超过诉讼时效后抵押权消灭。
抵押权不直接因时效而消灭：
- 抵押权是基于物权法定原则设立的，其消灭必须基于法律明确规定的情形。时效经过并不是抵押权消灭的法定事由，因此抵押权在时效经过后仍然实体存在。
二、抵押权不消灭的原因
物权属性的独立性：
- 抵押权作为担保物权，具有从属性特征，但其效力存续独立于债权诉讼时效。即使债权因超过诉讼时效丧失胜诉权，抵押权作为物权的法律地位不受影响，仅其实现可能受限于司法程序。
立法目的的实现：
- 《民法典》通过区分“行使抵押权”与“抵押权消灭”，既督促权利人及时维权，又保障抵押权人对抵押物的优先受偿权。这种制度设计平衡了交易安全与效率价值。
司法实践的延续性：
- 最高院通过判例明确，抵押权存续期间不受主债权诉讼时效限制。例如，（2021）最高法民申7956号裁定即体现这一裁判规则，强调抵押权不因主债权时效届满而自动灭失。
三、抵押权实现的限制条件
司法保护的时效性：
- 主债权诉讼时效届满后，抵押权人虽保有抵押权，但无法通过司法强制执行程序实现抵押权。此时债务人可援引时效抗辩对抗强制执行申请。
自愿履行的有效性：
- 若债务人在时效届满后仍自愿履行债务或配合处置抵押物，该行为合法有效。抵押权人可通过协商折价、拍卖等方式实现抵押权，但需确保处分过程符合法定程序。
四、实例分析
以甲向乙借款100万元并由丙提供房屋抵押担保为例：
- 借款期限为1年，自2023年1月1日起算。
- 若甲在借款到期后未还款，且乙在主债权诉讼时效期间内（即至2026年1月1日前）未向甲主张债权并行使抵押权，则主债权的诉讼时效期间届满。
- 此时，如果乙向法院起诉要求行使对丙房屋的抵押权，法院将不予保护。但这并不意味着乙的抵押权完全消失，如果丙自愿配合乙办理房屋的过户等实现抵押权的手续，那么丙之后不能再以主债权诉讼时效已过为由要求乙返还房屋或相应利益。
五、法律建议
及时行使权利：
- 抵押权人应在主债权诉讼时效期间内及时行使抵押权，以避免丧失司法保护。
保留证据：
- 抵押权人应保留好与主债权和抵押权相关的所有证据，以备不时之需。
寻求专业帮助：
- 如遇复杂情况或疑问，抵押权人应及时咨询专业律师，以获取更准确的法律意见和帮助。
综上所述，诉讼时效过后，抵押权本身并不消灭，但抵押权人在行使权利时需谨慎考虑相关法律规定和可能的限制。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。