软件著作权确实可以由法人和自然人同时共同享有。以下从不同角度为你详细分析：
法律依据与理论支持
根据《中华人民共和国著作权法》及相关规定，著作权属于作者，这是著作权归属的基本原则。在软件开发领域，作者可以是自然人，也可以是法人或其他组织。当软件是由法人组织或自然人独立开发完成时，著作权自然归属于该法人或自然人。然而，在实际情况中，软件的开发往往涉及多个主体的合作，包括法人组织和自然人。在这种情况下，著作权的归属就需要根据合作开发的具体情况来确定。
如果软件是由法人和自然人共同开发完成的，且双方在开发过程中都有实质性的贡献，那么他们可以共同享有该软件的著作权。这种共同享有著作权的情况在法律上是被认可的，也是符合著作权法原理的。共同享有的著作权意味着法人和自然人都有权使用、许可他人使用、转让或许可他人转让该软件的著作权，并有权因他人侵权而获得赔偿。
实际操作与注意事项
合作开发协议：为了避免未来可能出现的著作权纠纷，法人和自然人在共同开发软件时，应当签订详细的合作开发协议。协议中应明确双方的权利和义务，包括著作权的归属、使用、许可、转让以及侵权赔偿等方面的内容。
著作权登记：虽然著作权自作品创作完成之日起自动产生，但进行著作权登记可以更好地证明著作权的归属和存在。法人和自然人可以共同申请软件著作权的登记，以进一步确认他们的共同著作权人身份。
使用与许可：在共同享有著作权的情况下，法人和自然人应当协商一致后才能对外使用或许可他人使用该软件。如果一方未经另一方同意擅自使用或许可他人使用，可能构成侵权行为。
侵权赔偿：如果软件被他人侵权，法人和自然人作为共同著作权人，都有权要求侵权人停止侵权行为并赔偿损失。在赔偿分配方面，双方可以根据合作开发协议中的约定进行分配；如果没有约定或约定不明确，可以根据双方的贡献大小、实际损失等因素进行协商分配。
案例分析
假设某科技公司（法人）与一位独立开发者（自然人）共同开发了一款软件。在开发过程中，双方都有实质性的贡献，并签订了合作开发协议，明确约定了著作权的共同归属。后来，该软件被另一家公司侵权使用。在这种情况下，科技公司和独立开发者作为共同著作权人，都有权要求侵权公司停止侵权行为并赔偿损失。他们可以根据合作开发协议中的约定或双方的协商结果来分配赔偿金额。
总结与建议：软件著作权可以由法人和自然人同时共同享有，但双方应当签订详细的合作开发协议以明确权利和义务。在共同享有著作权的情况下，双方应当协商一致后才能对外使用或许可他人使用该软件，并共同维护自己的著作权权益。如果你在软件著作权方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。