协议书上有证人签字，并不直接等同于协议书在法律上生效，但证人签字可以作为协议书真实性和有效性的辅助证据。以下从不同角度为你详细分析：

协议书生效的法律要件

1. 双方意思表示真实：协议书的双方必须是在自愿、平等、公平的基础上，真实表达自己的意愿，没有受到欺诈、胁迫等不正当手段的影响。
2. 内容合法合规：协议书的内容必须符合法律法规的规定，不得违反公序良俗，不得损害国家、集体或第三人的利益。
3. 形式符合要求：虽然很多协议书并不要求必须采用书面形式，但为了证明协议的存在和内容，书面形式往往更为稳妥。此外，某些特定类型的协议书，如房地产买卖合同、借款合同等，可能还需要满足特定的形式要求，如公证、登记等。

证人签字的作用

1. 辅助证明真实性：证人签字可以在一定程度上证明协议书的签订过程是真实发生的，双方确实在协议书上签了字。这对于在后续可能出现的纠纷中，证明协议书的真实性是有帮助的。
2. 增强证据效力：如果证人能够出庭作证，详细描述协议书的签订过程、双方的表情、语气等细节，那么这份协议书的证据效力将得到进一步增强。

证人签字并非生效的绝对条件

1. 缺乏证人签字不影响协议书效力：即使协议书上没有证人签字，只要满足上述生效的法律要件，协议书仍然可以在法律上生效。证人签字只是辅助证据，并非必要条件。
2. 证人资格和证言真实性需审查：即使协议书上有证人签字，如果证人的资格存在问题（如与一方有利害关系），或者证言的真实性受到质疑（如证人记不清签订过程），那么证人签字的作用也将大打折扣。

实际操作建议

1. 确保协议书内容合法合规：在签订协议书前，务必仔细审查协议书的内容，确保其符合法律法规的规定。
2. 选择合适的签订形式：根据协议书的类型和重要性，选择合适的签订形式。对于重要的协议书，建议采用书面形式，并考虑进行公证或登记。
3. 保留相关证据：在签订协议书的过程中，可以邀请无利害关系的第三方作为证人，并保留好相关的证据材料，如照片、视频等。这些证据材料在后续可能出现的纠纷中，将起到重要的证明作用。

总结来说，协议书上有证人签字并不直接决定其法律效力，但证人签字可以作为辅助证据来增强协议书的真实性和有效性。在签订协议书时，应重点关注协议书的内容是否合法合规、签订形式是否合适以及相关证据的保留。如果你在协议书签订或履行过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。