针对违规套取单位经费应予以收缴还是责令退赔的问题，这主要取决于具体的违法情形和法律规定，但一般来说，两者都是可能的处理方式，具体分析如下：
责令退赔：
- 适用情形：当违规套取的单位经费尚未造成国有资产流失，或者虽然造成了流失但能够通过退赔方式挽回损失时，通常会责令相关责任人退赔。这种方式更侧重于恢复原状，即让单位的经济利益回到受损前的状态。
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔。在劳动工伤（工资福利）领域，如果涉及的是单位内部的经济违规行为，且未构成犯罪，但造成了单位经济损失，单位也有权依据内部规章制度或相关法律法规要求责任人退赔。
收缴：
- 适用情形：当违规套取的单位经费已经造成国有资产流失，且无法通过退赔方式完全挽回损失时，或者当违规行为性质严重，需要给予更严厉的处罚时，可能会采取收缴的方式。收缴通常意味着将违法所得的财物上缴国库或单位，不再返还给原所有人或使用人。
- 法律依据：同样依据《中华人民共和国刑法》第六十四条，对于违法所得的财物，除了责令退赔外，还可以予以追缴。在行政处罚领域，如《中华人民共和国行政处罚法》等法律法规也规定了对于违法所得的收缴措施。
法律建议：
- 对于单位而言，一旦发现违规套取经费的行为，应立即进行调查取证，确定违规行为的性质、金额和责任人。
- 根据调查结果，单位可以依据内部规章制度或相关法律法规，选择责令退赔或收缴等适当的处理方式。
- 如果违规行为涉嫌犯罪，单位应及时向公安机关报案，并配合司法机关进行调查和处理。
可能后果：
- 如果责任人被责令退赔或收缴违法所得，其个人经济利益将受到直接损失。
- 如果违规行为构成犯罪，责任人还将面临刑事处罚，如有期徒刑、罚金等。
- 对于单位而言，及时处理违规行为有助于维护内部管理秩序和经济效益，避免更大的经济损失和声誉损害。
总结来说，违规套取单位经费的处理方式取决于具体情形和法律规定，单位应根据实际情况选择合适的处理方式，并依法维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。