关于辞退员工与单位协商一致时赔偿金的计算，主要依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，并结合双方协商的具体情况来确定。以下是从不同角度对这一问题的详细解答：
一、经济补偿金的基本计算原则
工作年限与补偿金关系：
- 根据《劳动合同法》第四十七条，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
- 六个月以上不满一年的，按一年计算，即支付一个月工资的补偿金。
- 不满六个月的，单位支付半个月工资的补偿金。
月工资标准的确定：
- 月工资指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，包括计时工资、计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。
- 若月平均工资低于当地最低工资标准，则按最低工资标准计算。
- 若员工工作不满十二个月，则按实际工作的月数计算平均工资。
计算公式：
- 经济补偿金 = 工作年限 × 月工资（工作年限满整年时）
- 经济补偿金 = （工作年限 + 0.5）× 月工资（工作年限包含六个月以上不满一年的部分时）
- 经济补偿金 = 0.5 × 月工资（工作年限不满六个月时）
举例：假设张三在某单位工作了3年零7个月，其解除劳动合同前十二个月的平均工资为5000元。那么，单位应支付给张三的经济补偿为4个月工资，即4 × 5000 = 20000元。
二、协商一致时的特殊约定
- 双方协商一致解除劳动合同时，补偿金额可以突破法定标准，具体由双方协议确定。这意味着，如果双方认为法定标准不足以弥补员工的损失或体现公平，可以在协商中约定更高的补偿金额。
三、违法解除劳动合同的赔偿标准（虽协商一致，但此点作为法律背景知识供参考）
- 若用人单位违反法律规定解除或终止劳动合同，则需依照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。这一点在协商一致的情况下通常不适用，但作为法律背景知识，有助于理解赔偿金的计算原则。
举例（仅作背景知识参考）：假设李四在某单位工作了2年零3个月，其解除劳动合同前十二个月的平均工资为6000元。若单位违法解除劳动合同，则应支付给李四的赔偿金为2.5个月工资的二倍，即2.5 × 6000 × 2 = 30000元。
四、特殊情形下的补偿金限制
- 对于高收入员工，存在补偿金上限的规定。若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
举例：假设某地区上年度职工月平均工资为5000元，其三倍为15000元。王五在某单位工作了15年，月工资为20000元。此时，王五的经济补偿按月工资15000元计算，且年限最高按12年计算，即经济补偿为12 × 15000 = 180000元。
五、实际操作建议
- 明确协商内容：在协商一致解除劳动合同时，双方应明确补偿金额、支付方式、支付时间等关键条款，并签订书面协议以避免后续纠纷。
- 保留相关证据：员工应保留好与单位协商解除劳动合同的相关证据，如协商记录、书面协议等，以备不时之需。
- 咨询专业意见：虽然双方可以协商一致确定补偿金额，但为了确保协议的合法性和公平性，建议双方在协商前咨询专业律师的意见。
总结：辞退员工与单位协商一致时赔偿金的计算，主要依据《劳动合同法》的相关规定，并结合双方协商的具体情况来确定。在协商过程中，双方应明确补偿金额等关键条款，并签订书面协议以避免后续纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。